龙眼是原产于我国南方的特产果树，其资源丰富，种类品种繁多。广西是龙眼原产地之一，也是龙眼主要产区。为了更好地对广西龙眼种质资源评价及创新利用，需要在遗传上进行分类鉴定和亲缘关系探讨。应用AFLP等分子标记技术对果树种质鉴定尤其是优良类型和品种的鉴定己成为育种的基础和发展生产的前提。本研究应用AFLP标准化反应体系，对原产于广西的龙眼品种(单株)，以及广东、福建、泰国的龙眼品种和龙眼近缘种质进行了AFLP分析，构建了它们的指纹图谱及对其遗传多样性进行了分析。主要研究结果如下：1．改良3×CTAB法适合龙眼基因组DNA的提取，用该法得到的DNA浓度大、质量高，去除蛋白质、多糖和RNA彻底，满足AFLP银染技术对DNA的要求。2．用E-ACA／M-CGA、E-AGG／M-CAT等10对引物对48个龙眼品种(单株)及2个近缘种质进行扩增，共扩增出569条谱带，其中多态性谱带475条，多态性比例为83.5％。这些结果从DNA水平上反映了广西龙眼种质资源基因型间存在着相对较为丰富的遗传多样性。3．构建了48个龙眼品种(单株)及2个近缘种质的指纹图谱。4．对供试材料的遗传多样性进行分析，建立了龙眼的AFLP亲缘关系聚类图，将48个龙眼品种(单株)及2个近缘种质聚类分成10个类群。