计算化学e-Science中化学数据库管理工具的研究与实现

来源 :兰州大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:cocomalully
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
近几十年来,化学数据库已经成为化学研究工作中一个必不可少的工具。随着化学科学研究的不断信息化,化学数据库的发展也是层出不穷。众多的化学数据库在一定程度上确实方便了化学家的科研工作,但是另一方面,各种数据库之间查询和操作方式的差异,则严重影响了化学家享受这种数据共享带来的科研便利性。因此,为化学家提供一种统一的数据查询方式,屏蔽各种化学数据库之间查询和操作方式的差异,将极大地方便化学工作者的研究工作。 数据是化学科研工作中的核心部分,化学家可以从化学数据库检索到需要的数据,也可以从具体实验中获得数据。当数据在本地积累到一定数量的时候,如何有效的组织和管理这些数据将变得异常重要,例如本地数据的查询、查看、分子属性的计算等,直接关系到能否取得科研成果。因此化学家需要一种统一、高效的方式来组织、管理和查询本地的化学数据。 本文所做的工作也正是围绕目前化学研究领域内存在的这两个问题而展开,通过研究和分析典型化学数据库及其管理工具和计算化学e-Science建设中对化学数据库的统一查询及对本地化学数据的管理需求,研究和实现一个个性化的化学数据库管理工具来解决上述两方面的问题。利用此工具化学家既能建立本地的数据库对本地数据进行高效的组织和管理,也能在一个统一的查询界面对化学数据库进行查询,屏蔽化学数据库之间操作的差异性。本文重点实现了本地化学数据的组织和管理,通过利用内嵌式数据库Derby和开源化学信息开发工具包实现了化学数据在数据库中的存储、分子结构的查看和编辑、二维分子子结构的查询和分子属性的计算等;然后对化学数据库的统一查询方式方面进行了简单的示范性研究。
其他文献
连续优化问题普遍存在于数学,计算机科学,金融学,工程等研究领域和应用实践中。一般的,一个最优化问题指的是,对于一个目标函数f(x),在其可行域中找到其关于x的最小值或最大
聚类分析作为数据挖掘领域中的一个重要分支,研究数据对象的分类问题,在模式识别、图像处理、市场研究以及生命科学等众多学科领域具有广泛的应用前景。DBSCAN算法因为可以发现
服务质量QoS(Quality of Service)指网络在传输端到端数据时必须满足的一套可测量的预先定义的基于端到端性能的服务属性。随着移动自主网络(Ad Hoc)的迅速发展,越来越多的应
P2P是英文Peer-Tro-Peer的缩写,即对等网络或对等计算。在P2P网络中,所有节点拥有相同的地位,它们之间没有服务器与客户机之分。随着P2P应用的迅速发展,P2P网络的安全性问题越来
参数的配对组合测试要求系统中每一对输入参数,它们每一个有效值的组合都必须被至少一个测试案例覆盖。实践表明,参数的配对组合测试是对于各种系统的一种实用且有效的测试方
目前信息主导的时代,海量数据存储在数据库或者数据仓库中。面对这种“信息爆炸”的现实,如何从海量数据中提取有价值的信息已显得尤为重要。数据挖掘技术的出现和发展为人们解
随着Internet的发展,多媒体通信和分布式环境下的协同工作等应用促使了多播通信的发展。多播问题的关键在于多播路由的确定,即寻找简单、高效、健壮的多播路由算法,多播路由算法
学位
随着我国数字电视时代的到来,HFC(Hybrid Fiber-Coax,光纤同轴混合网)网所承载的业务也越来越多,对该网络传输的可靠性提出了更高的要求,为了保障HFC网络的稳定性,一种有效的
随着多媒体应用技术的流行,对数据网络支持此类应用的要求也不断增多。多媒体应用有它特有的服务质量(QoS)要求,而现在广泛应用的IEEE802.11MAC层协议不能对多媒体流提供足够
人脸识别是指对未知人脸,利用图象处理或模式识别等技术从中提取出特征,并将其与数据库中的已知人脸特征进行匹配,以确定其身份的过程。该技术是生物特征识别领域的重要组成