综合交通运输系统是由铁路、公路、水运、航空、管道运输五种运输子系统构成的复杂系统。随着我国经济的持续快速增长,综合交通运输已成为整个国民经济继续保持较快发展的“瓶颈”,其实质是综合交通运输系统没能很好地协调发展。基于此,本文针对我国综合交通的协调发展若干问题展开研究。本文首先借助灰色关联理论对我国综合交通各运输方式的客运及货运影响因素做出全面分析,找出各种运输方式客货运输的主要影响因素。研究结果表明,(人均)国民生产总值及人均消费支出是影响综合交通客货运输的主要因素。运用信息熵及组合预测理论,建立了基于熵的组合预测模型,通过实证对比研究得知,所建立的熵权组合预测模型具有较高的预测精度。运用该模型对我国2004～2020年的客运量、客运周转量、货运量、货运周转量进行预测,以确定未来几年综合交通运量的合理规模。运用数据包络分析法对我国铁路、公路、民航、水运四种运输方式的运行效率从相对有效性、规模收益、投资剩余及产出亏空等方面进行了全面的评价。结果显示,这四种运输方式普遍具有规模收益递增的现象,增加四种运输方式的投资可以获得较好的产出,这也从另一方面说明我国的综合交通运输在整体上是投入不足的。运用数据包络分析方法的思想及协调发展理论,给出了评价多个子系统间协调发展程度的评价模型,并运用该模型对我国综合交通四种运输方式之间的协调发展程度进行了评价。研究结果表明:铁路运输与水运的协调发展关系程度最高;公路运输与铁路、水运两种运输方式之间有着较好的协调发展关系;民航与其它三种运输方式之间的协调发展程度在所有两种运输方式之间的协调发展效度中是最低的。通过对我国综合交通系统与社会经济系统间协调发展关系的研究,结果表明:国家对社会经济和综合交通的投入不足,并且对综合交通投入的不足程度要比对社会经济系统的投入不足程度严重,这也是我国的交通运输成为经济持续快速发展“瓶颈”的一个科学解释。本文对我国综合交通协调发展若干问题所进行的研究与分析,可以为提高各种运输方式的运行效率,有效解决各种运输方式之间、交通与社会经济之间协调发展问题的改进方向及改进量等方面提供理论依据。