食管癌是我国常见的恶性肿瘤之一,其中河南省林州市食管癌的发病率高达150/10万。食管癌进展迅速,侵袭性强且常伴有淋巴结转移,易复发,预后差。常规手术治疗及放、化疗效果均不能令人满意。所以,寻求食管癌治疗的新方法为当前研究热点。基因芯片亦称DNA微阵列或寡核苷酸微阵列,是20世纪90年代后发展的一项DNA分析新技术,它是以微阵列方式将基因片段或大量寡核苷酸有序地、高密度地排列在某种固相载体上检测特定基因表达的一种技术,如：玻片、硅片和尼龙膜(一般为1cm2左右)。其检测的基本原理是分子杂交,碱基互补。具体过程是：在固相支持物上排列大量的探针分子,然后利用荧光标记序列或样品(DNA或cDNA)同芯片上的探针分子进行杂交,接着将固相支持物上没有发生互补结合反应的片段除去,利用激光共聚焦显微镜进行扫描,再借助计算机软件对荧光信号强、弱的分析处理,最后推测出样品中相关基因的大量的定量信息。目前,国内外利用基因芯片技术筛选各类肿瘤组织如：卵巢癌、胃癌等的差异表达基因已经取得一定成绩,食管癌方面也有少量报道。本实验通过基因芯片技术对食管鳞癌的基因表达情况进行分析,通过与正常食管黏膜组织基因表达情况对比,找到异常表达的基因,以寻找与食管鳞癌发生、发展有关的基因,为食管鳞癌的早期诊断、预防和治疗提供高特异性、高敏感性的分子标记和靶基因。方法提取河南省肿瘤医院5例食管鳞癌患者和周围正常食管鳞状上皮组织的mRNA,然后逆转录成cDNA,并用单标法将Cy3-dUTP标记于食管鳞癌组织及其周围正常组织后制成探针,在适当的条件下与基因芯片进行杂交,经特殊扫描仪扫描后,进行计算机软件分析,最后得到筛选结果。另取30例标本利用RT-PCR对筛选结果进行验证。结果依Ratio实验组(癌组织)/对照组(正常食管组织)>4.0或<0.25的数据项,在5例新鲜标本的芯片杂交检测中共筛选出1113条基因发生差异表达,其中上调的有464条,下调的有649条,将这些基因按GO (gene ontology)分子功能(function term)进行分类,发现这些差异表达基因与信号传导,分子定位、连接,酶活性调节,细胞分化、成熟以及基因转录、翻译调节有关。RT-PCR验证3条基因,显示其表达方向与芯片检测一致,符合预期结果。结论1.有大量差异表达基因存在于食管鳞癌的发生、发展过程当中。2.基因芯片是一高效、可靠筛选食管鳞癌差异表达基因的方法。