基于转录组测序冬虫夏草虫草素合成基因的预测、RNR基因克隆与表达研究

来源 :成都中医药大学 | 被引量 : 1次 | 上传用户:pearwj
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
冬虫夏草是我国著名的名贵中药,具有悠久的药用历史。虫草素作为冬虫夏草的有效成分之一,是第一个从真菌中分离出来的核苷类抗菌素。近年来其抗菌、抗肿瘤、免疫调节及抗炎等方面是研究热点,但其合成机制尚未理清,影响了大规模应用。因此,虫草素生物合成机制成为关键。本研究利用Illumina/Solexa HiSeq 2500高通量测序平台对冬虫夏草菌丝体和子实体转录组进行测序、数据组装、分析并预测虫草素合成相关基因及差异表达水平,发现代谢途径中多数酶在菌丝体发育阶段的表达水平较高,其中RNR(核糖核苷酸还原酶)是腺苷代谢的关键酶,从转录组数据中挖掘到RNR大小亚基各1条,及4条RNR同源序列。RNR大小亚基作为后续研究的对象。采用cDNA克隆技术从新鲜冬虫夏草子实体中克隆到RNR基因大小亚基,RNRL(RNR大亚基)cDNA全长2733bp,编码910aa,RNRM(RNR小亚基)cDNA全长1257bp,编码418aa。通过保守区域和功能结构域分析发现主要催化活性位点位于RNRL,RNRM含有铁结合蛋白保守位点,大小亚基均含有二聚体和亚基结合区域。通过设计带flag表达标签的引物,利用PCR得到RNRL和RNRM基因片段,并分别插入到YEp351和YEp352质粒中,得到YEp351-RNRL和YEp352-RNRM重组质粒,分别转入大肠杆菌DH5α中,测序结果表明重组质粒构建完成。采用LiAc转化法将重组表达质粒YEp351-RNRL和YEp352-RNRM同时转化到酿酒酵母(Sacchaminyces cerevisiae)BY4741,利用缺乏亮氨酸和尿嘧啶的Leu Ura Minus Media培养基筛选重组子,并利用PCR鉴定得到阳性转化子。利用实时荧光定量PCR和Western Blot鉴定表达产物,结果表明,RNRL和RNRM分别已在基因和蛋白质水平上表达。利用HPLC检测终产物虫草素,利用UPLC-MS/MS检测虫草素合成的中间产物3’-dADP。实验确定样品峰质谱离子为[M+H]+(m/z 412.04202),分子式显示为C10H15N5O9P2,该信息与3’-dADP物质一致。由于3’-dADP的化学性质未见报道,其保留时间与同分异构体2’-dADP(已知物质)可能一致。因此,下一步将进一步确认中间产物3’-dADP,以明确预测的合成途径。
其他文献
随着基因工程技术的发展,蛋白质类药物的应用越来越受到人们的青睐。但蛋白质类药物具有血浆半衰期较短、有一定的免疫原性等不足之处,在一定程度上限制了其临床应用。由于聚乙
人们对肺炎球菌的认识始于19世纪80年代初期,1911年开始用肺炎球菌疫苗来预防肺炎球菌性疾病。迄今已发现90余个不同的肺炎球菌的功型,但仅有少数是引起疾病的。本文对肺炎球菌
SARS的病理很有特点:第①周机体动员了非特异性免疫机制,第②周病毒溶解细胞反应破坏了大量免疫细胞,迟发型变态反应引起重症患者的非心源性肺水肿,第③周病情好转后部分患者
对目前常用的几种典型交会测量方法进行了理论上的精度分析 ,并利用某大坝水平位移监测点的实测数据进行分析、验证 ,得出了一些有益的结论。
胃溃疡在抑酸药物和Hp三联疗法根除治疗后,内镜显示愈合,却存在组织学和超微结构结构的异常,因此Tamawski等提出溃疡愈合质量的概念,本文主要从胃溃疡愈合质量影响因素如Iqp、基