甲基化相关基因与早发性精神分裂的关联研究

来源 :上海交通大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wanwan1984
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第一部分亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因与早发性精神分裂症易感性研究   目的:探讨亚甲基四氢叶酸还原酶(MTHFR)基因与精神分裂症的关系。   方法:采用病例对照以及核心家系研究,使用聚合酶链反应一限制性片段长度多态性方法,分析394例早发性精神分裂症患者的MTHFR基因2个功能多态性位点(A1298C和C677T)的分布频率,并用399名健康对照者作对照,同时对111例核心家系的MTHFR基因进行复核研究。   结果:   1.MTHFR基因病例对照研究:(1)病例组和对照组的2个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)单位点A1298C分布频率在患者组与对照组之间存在显著性差异(P=0.02)。(3)位点A1298C和C677T之间连锁不平衡(D'=0.724),单体型分析显示单体型1298C-677C为精神分裂症的风险单体型(P=0.03)。   2.MTHFR基因核心家系研究:(1)核心家系患者组及其父母组的2个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)单位点TDT分析未发现1298C和677T等位基因从父母优先传递给患病子女(P>0.05)。(3)单体型TDT分析显示位点A1298C和C677T之间存在中度连锁不平衡(D’=0.529),未发现A1298C-C677T各单体型与精神分裂症存在显著性关联(P>0.05)。   3.患者母亲与健康者母亲的MTHFR基因多态性分析:(1)患者母亲和健康者母亲的2个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)单位点A1298C分布频率在患者母亲与健康者母亲之间存在显著性差异(P=0.03)。(3)位点A1298C和C677T之间存在强连锁不平衡(D'=0.78),单体型分析显示患者母亲1298C-677C单体型分布显著高于健康者母亲组(P=0.04)。   结论:   1.MTHFR基因可能是中国汉族人群精神分裂症的易感基因。   2.母亲携带1298C等位基因是子代精神分裂症发生的一个危险因素。   3.相比核心家系研究,病例对照研究方法更适用于MTHFR基因与精神分裂症的关系研究。   第二部分 DNA甲基转移酶1基因(DNMT1)与早发性精神分裂症的易感性研究   目的:探索DNA甲基转移酶1基因(DNMT1)与精神分裂症的易感性之间的关系。   方法:采用病例对照以及核心家系研究,使用TaqMan探针方法,分析373例早发性精神分裂症患者的DNMT1基因多态性分布频率,并用339名健康对照者作对照,同时对95例核心家系的DNMT1基因进行复核研究。   结果:   1.DNMT1基因病例对照研究:(1)病例组和对照组的3个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)单位点rs2288350、rs8101626以及rs8111085分布频率在患者组与对照组之间未发现存在显著性差异(P>0.05)。(3)位点rs2288350-rs8101626之间存在强连锁不平衡(D’=0.880);位点rs8101626-rs8111085之间存在强连锁不平衡(D’=0.936),单体型分析显示病例组中rs2288350C-rs8101626G-rs8111085A单体型分布显著低于对照组(P=0.048)。   2.DNMT1基因核心家系研究:(1)核心家系患者组及其父母组的3个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)单位点TDT分析:rs2288350、rs8101626以及rs8111085与精神分裂症不存在显著性关联(P>0.05)。(3)单体型TDT分析:位点rs2288350-rs8101626之间存在强连锁不平衡(D’=0.940);位点rs8101626-rs8111085之间存在强连锁不平衡(D’=0.883),未发现rs2288350-rs8101626-rs8111085各单体型与精神分裂症存在显著性关联(P>0.05)。   结论:   研究结果提示DNMT1基因单体型rs2288350C-rs8101626G-rs8111085A与精神分裂症关联,DNMT1基因可能是中国汉族人群精神分裂症的易感基因。   第三部分 DNA甲基转移酶3B与早发性精神分裂症的易感性研究   目的:探索DNA甲基转移酶3B基因(DNMT3B)与精神分裂症的易感性之间的关系。   方法:采用病例对照以及核心家系研究,使用TaqMan探针方法,分析381例早发性精神分裂症患者的DNMT3B基因多态性分布频率,并用472名健康对照者作对照,同时对103例核心家系的DNMT3B基因进行复核研究。   结果:   1.DNMT3B基因病例对照研究:(1)病例组和对照组的2个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)单位点rs6119954分布频率在患者组与对照组之间存在显著性差异(P=0.023)。(3)位点rs2424908和rs6119954之间存在强连锁不平衡(D’=0.810):单体型分析显示病例组中rs2424908T-rs6119954G单体型分布显著高于对照组(P=0.003)。   2.DNMT3B基因核心家系研究:(1)核心家系患者组及其父母组的2个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)单位点TDT分析:rs6119954位点与精神分裂症存在显著性关联(P=0.02)。(3)单体型TDT分析:位点rs2424908和rs6119954之间存在强连锁不平衡(D’=0.820);未发现rs2424908-rs6119954各单体型与精神分裂症存在显著性关联(P>0.05)。   结论:   研究结果提示DNMT3B基因rs6119954位点与精神分裂症存在显著性关联,DNMT3B基因可能是中国汉族人群精神分裂症的易感基因。   第四部分DNA甲基化转移酶3B基因和多巴胺D1受体基因交互作用与精神分裂症的关系研究目的:探索多巴胺D1受体(DRD1)基因与精神分裂症的易感性之间的关系,及其与本研究提示为精神分裂症易感基因的DNMT3B基因之间是否存在相互作用。   方法:采用病例对照以及核心家系研究,使用 TaqMan探针方法,分析373例早发性精神分裂症患者的DRD1基因多态性分布频率,并用379名健康对照者作对照,同时对95例核心家系的DRD1基因进行复核研究。结合本研究第三部分病例组及对照组样本DNMT3B基因的实验数据,使用MDR软件对DRD1基因的5个SNPrs4532、rs5326、rs2168631、rs6882300和rs267418和DNMT3B基因的2个SNP rs2424908以及rs6119954进行基因一基因交互作用分析。   结果:   1.DRD1基因病例对照研究:(1)病例组和对照组的5个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)DRD1基因各单位点分布频率在患者组与对照组之间未发现显著性差异(P>0.05)。(3)位点rs4532-rs5326之间存在强连锁不平衡(D’=0.920);位点rs2168631-rs6882300之间存在强连锁不平衡(D’=0.830):位点rs6882300-rs267418之间存在强连锁不平衡(D’=0.872);单体型分析未发现各单体型在病例组与对照组之间存在显著性差异(P>0.05)。   2.DRD1基因核心家系研究:(1)核心家系患者组及其父母组的5个SNPs均符合H-W平衡(P>0.05)。(2)单位点TDT分析:未发现各单位点与精神分裂症存在显著性关联(P>0.05)。(3)单体型TDT分析:位点rs4532与rs5326之间存在强连锁不平衡(D’=1.000);位点rs2168631与rs6882300位点之间存在明显的连锁不平衡(D’=0.779);未发现各单体型在父母与患病子女间传递差异具有统计学意义(P>0.05)。   3.MDR软件分析结果显示:两位点(rs6119954-rs267418)、三位点(rs6119954-rs5326-rs267418)以及四位点(rs2424908-rs6119954-rs5326-rs267418)的模型有统计学意义(P<0.05)。   结论:   1.未发现DRD1基因与精神分裂症之间存在显著性关联   2.DRD1基因与DNMT3B基因之间可能存在相互作用,增加精神分裂症的发病风险。
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