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本文研究了大豆花叶病毒(Soybean mosaic virus,SMV)的抗性(Resistance,R)基因SRC7(SMV resistance cluster7)的作用机理。SRC7编码TIR-NBS-BSP蛋白,其中BSP(Basic secretory protein)是一种非典型的、功能未知的结构域。本实验室前期工作中,结构域截短实验证明SRC7TN(TN为TIR-NBS的缩写)对病毒具有抗性,但SRC7的作用机理尚不清楚。因此,本研究系统研究了SRC7的抗病毒作用机制,证实了一个新的BSP结构域的功能,揭示了SRC7亚细胞定位在免疫反应中的作用。探讨了SRC7在转录调控、分子内自我调控及同源蛋白之间的多层调控机制,为大豆抗SMV研究及植物免疫反应机理的阐明提供了重要依据。主要研究结果如下:
从大豆基因组上克隆了SRC7基因不同长度的启动子序列,构建了启动子-GUS截断载体,用瞬时和稳定转化法分析了表达体系中SRC7基因的转录调控机制。结果表明,SRC7基因的转录受到SMV侵染或植物激素水杨酸(SA)的诱导。亚细胞定位实验结果显示,SRC7和SRC7TN均定位在细胞核。核定位信号存在于SRC7NBS结构域,并且核定位对于SRC7的抗病毒活性是必须的。酵母双杂交(Y2H)和双分子荧光互补(BiFC)实验证明SRC7通过TIR和NBS结构域在细胞核中进行同源寡聚化。通过定点突变及BiFC实验找到了与SRC7寡聚化有关的保守位点(F18、R24、D45、L59、F82、E86)及TIR结构域里的αA2基序。SRC7的寡聚化对其抗病毒活性必不可少。进一步分析发现,SRC7TIR介导免疫反应,而SRC7NBS通过顺式作用方式增强SRC7TIR的抗性。虽然SRC7BSP对于SRC7抗病毒活性是非必需的,但是SRC7BSP能够与SRC7TIR和SMV效应因子6K2互作。SRC7BSP不仅参与SMV的特异性识别,并通过分子内相互作用调控SRC7的蛋白稳定性和活性。
更为重要的是,SRC7的抗病毒活性受到与其紧密连锁的SRC3和SRC13的拮抗抑制。SRC3和SRC13为TNL(TIR-NBS-LRR)类蛋白,其TIR-NBS部分与SRC7同源性高达80%,然而它们对SMV和TMV(Tobacco mosaic virus)均不具有抗性。Y2H、BiFC和荧火素酶互补实验表明,SRC3TN和SRC13TN与SRC7TN形成异源寡聚体,从而抑制SRC7TN同源寡聚体的形成。进一步实验证明,SRC3TN和SRC13TN的这种拮抗效应是通过它们的TIR结构域来实现的。通过SRC3TN、SRC13TN和SRC7TN的氨基酸进行序列比对,发现它们之间氨基酸残基具有多态性。通过对这些多态性氨基酸残基的置换和定点突变,筛选到了SRC7TN抗病毒相关的关键基序和氨基酸残基。其中,αA2基序中保守的G29/N30定性决定寡聚化的形成,而E37/H41或K38/H41定量影响着SRC7的寡聚化程度。TIR结构域中的I177等位点决定着SRC3TN、SRC13TN和SRC7TN之间抗病性的差异。NBS结构域中的p-loop基序及其相关位点的多态性对于SRC7的抗病毒特异性具有关键作用。
综上所述,本研究分析了C-末端具有功能未知的BSP结构域的新型R蛋白SRC7的作用机制,证明其抗病毒活性在转录和蛋白水平上受到调控,尤其受到两个连锁基因SRC3和SRC13的拮抗作用,而这种TNL蛋白对之间的拮抗关系在植物中尚属首次报道。
从大豆基因组上克隆了SRC7基因不同长度的启动子序列,构建了启动子-GUS截断载体,用瞬时和稳定转化法分析了表达体系中SRC7基因的转录调控机制。结果表明,SRC7基因的转录受到SMV侵染或植物激素水杨酸(SA)的诱导。亚细胞定位实验结果显示,SRC7和SRC7TN均定位在细胞核。核定位信号存在于SRC7NBS结构域,并且核定位对于SRC7的抗病毒活性是必须的。酵母双杂交(Y2H)和双分子荧光互补(BiFC)实验证明SRC7通过TIR和NBS结构域在细胞核中进行同源寡聚化。通过定点突变及BiFC实验找到了与SRC7寡聚化有关的保守位点(F18、R24、D45、L59、F82、E86)及TIR结构域里的αA2基序。SRC7的寡聚化对其抗病毒活性必不可少。进一步分析发现,SRC7TIR介导免疫反应,而SRC7NBS通过顺式作用方式增强SRC7TIR的抗性。虽然SRC7BSP对于SRC7抗病毒活性是非必需的,但是SRC7BSP能够与SRC7TIR和SMV效应因子6K2互作。SRC7BSP不仅参与SMV的特异性识别,并通过分子内相互作用调控SRC7的蛋白稳定性和活性。
更为重要的是,SRC7的抗病毒活性受到与其紧密连锁的SRC3和SRC13的拮抗抑制。SRC3和SRC13为TNL(TIR-NBS-LRR)类蛋白,其TIR-NBS部分与SRC7同源性高达80%,然而它们对SMV和TMV(Tobacco mosaic virus)均不具有抗性。Y2H、BiFC和荧火素酶互补实验表明,SRC3TN和SRC13TN与SRC7TN形成异源寡聚体,从而抑制SRC7TN同源寡聚体的形成。进一步实验证明,SRC3TN和SRC13TN的这种拮抗效应是通过它们的TIR结构域来实现的。通过SRC3TN、SRC13TN和SRC7TN的氨基酸进行序列比对,发现它们之间氨基酸残基具有多态性。通过对这些多态性氨基酸残基的置换和定点突变,筛选到了SRC7TN抗病毒相关的关键基序和氨基酸残基。其中,αA2基序中保守的G29/N30定性决定寡聚化的形成,而E37/H41或K38/H41定量影响着SRC7的寡聚化程度。TIR结构域中的I177等位点决定着SRC3TN、SRC13TN和SRC7TN之间抗病性的差异。NBS结构域中的p-loop基序及其相关位点的多态性对于SRC7的抗病毒特异性具有关键作用。
综上所述,本研究分析了C-末端具有功能未知的BSP结构域的新型R蛋白SRC7的作用机制,证明其抗病毒活性在转录和蛋白水平上受到调控,尤其受到两个连锁基因SRC3和SRC13的拮抗作用,而这种TNL蛋白对之间的拮抗关系在植物中尚属首次报道。