【摘 要】
：
在论文的第一部分,我们用双湮灭方法计算了谷氨酰胺结合蛋白(GInBP)单体和底物GIn结合的绝对结合自由能.模拟得到的结果是-14.59 KcaI/moI,与实验值-8.025 Kcal/moI接近,并分
论文部分内容阅读
在论文的第一部分,我们用双湮灭方法计算了谷氨酰胺结合蛋白(GInBP)单体和底物GIn结合的绝对结合自由能.模拟得到的结果是-14.59 KcaI/moI,与实验值-8.025 Kcal/moI接近,并分析了双湮灭方法的优点和不足,并对该方法的改进提出了一些建议.论文的第二部分工作是选择了GInBP 体单和谷氨酰胺结合蛋白(GInBP-GIn)复合物体系为研究对象.使用GROMOS96程序及其力场分别进行了600ps的MD模拟.通过两个模拟所得到的轨迹,我们从体系的分子结构、自由能、铰链区柔性、口袋区相互作用及底物结合的特异性等几个方面分析了该体系的构象开合机制,得到了与实验数据是相吻合的结果.在论文的最后一部分,我们选择了R6态胰岛素六聚体这个较大的蛋自为研究对象,把FDSD模拟结果与MD模拟和通常的真空SD模拟结果作了比较.结果表明:FDSD模拟方法对于研究分子的结构和动力学性质均比真空SD模拟有很明显的改善,与MD模拟结果接近.
其他文献
论文提出用ANSYS软件对传感器的弹性元件结构进行优化的方法，研究了如何用ANSYS软件实现弹性元件的结构优化，以应变计式引伸计弹性元件的结构优化为例，建立了应变计式引伸计弹性
发展光伏发电技术是未来电力系统发展的必然趋势。在政府优先并网政策和财政补助的鼓励下，光伏发电这一新能源产业迅速发展，并网安装容量持续增加。分布式电源作为电网的有益补
该文基于线性压电理论和有限元方法,对双边切割的压电双相材料试样界面钝裂纹和邻近微孔洞的交互作用进行了分析.为了与实际情况更为接近,该文采用半圆模拟钝裂纹尖端,并通过
随着现代工业生产规模的不断增大，对生产装置及人员安全保护的要求也不断加强，ESD系统(Emergency Shut Down System紧急停车系统的简称)已经被广泛应用于石油化工、冶金、电力
该文基于直接模拟Monte Carlo(DSMC)方法建立了再入飞行器稀薄高超音速绕流的数值模拟方法及通用计算软件,研究分析了"神舟"号飞船返回舱在稀薄过渡流区域的空气动力特性,以
为了保证电力系统的安全运行,需要经常对高压电气设备进行绝缘检测。高压电容型设备在电力系统中占有很大的比例,而介质损耗因数是反映其绝缘状况的重要参数。然而,现有的介质损耗测试系统普遍存在稳定性差、精度较低、可扩展性差、软硬件无法及时升级等缺点,因此介质损耗测试系统的研究和开发具有十分重要的意义。本文对现有介质损耗测试系统进行了分析,并且结合了SOPC技术的发展趋势和实际应用现状,设计并实现了基于SO
牵引负荷为变化频繁的单相交流负荷,使电气化铁道牵引供电系统三相严重不平衡,并且存在无功和谐波电流。为了降低三相不平衡的影响,牵引变压器采用换相联接,导致各供电区段电
该文的研究对象为非定常流动.该文克服了以往双曲型方程的变分原理在处理初终值条件上存在的先天性缺陷,以一维变形管中非定常流动为例,成功地建立了双曲型方程初、边值问题
该文在以前的研究基础上对以下几个问题进行了深入的研究:1.温度对光纤光栅测量值的影响;温度和应变都能引起光纤光栅的波长漂移.该文从理论和室内试验两个方面都证明当温度
由于单流道泵仍然是一种特殊的叶片式离心泵,其内部能量转换是通过液体绕流复杂单流道泵叶片来实现的,所以研究泵内的流动应该把涡室和叶轮作为整体联系起来考虑.该文按照这