CE(Capillary Electrophoresis)毛细管电泳是以毛细管为分离通道、以高压直流电场为驱动力的液相分离技术,微流控CE芯片是将常规毛细管电泳转移到芯片上,在芯片上完成样品的进样、反应、分离、检测等。相对于普通的毛细管电泳,微流控CE芯片具有低成本、高效率等特点。本文就微流控CE芯片的设计及工艺做了相关的研究,搭建了以微流控CE芯片为主体的集成光纤式诱导荧光检测系统,并在此基础上,对CE芯片与PCR (Polymerase Chain Reaction)芯片集成技术进行了一定研究,以期在同一块芯片上实现生物样品的扩增、分离和实时检测,这也是微流控CE芯片的发展趋势之一。本检测系统主要分为五个部分,主体为作者设计的PDMS+PDMS +玻璃三层结构的微流控CE芯片,芯片加工流程简单,键合紧密,其结构设计能够有效减小样品的拖带现象,同时保证光纤中心与通道完全对准。芯片外接光路系统、电压源系统、光电信号转换系统及信号放大收集系统。该系统以蓝色LED为激发光源,多模光纤为光传输通道,通过光电倍增管将样品受激发产生的荧光进行光电信号转换,由PXIe-6124数据采集卡采集数据后在显示屏上显示。使用该系统进行了生物实验,在130s内完成了FITC标记的三种氨基酸精氨酸、苯丙氨酸、甘氨酸混合物的分离,表明了该系统的可靠性和实用性。本论文主要包含了以下几个内容:1介绍微流控CE芯片系统的原理及国内外的微流控芯片系统的研究进展。2通过CoventorWare软件对微流控CE芯片进行仿真,探讨了不同形状的微流控通道及不同进样方式的优缺点,根据仿真结果,设计了一种PDMS+PDMS+玻璃三层结构的微流控CE芯片并优化了相关参数。3探讨了微流控CE芯片的加工流程,优化并确定了相关工艺参数,通过软光刻法制得含有微通道的PDMS盖片,通过去离子法实现盖片与玻璃基底之间的不可逆封接,完成了CE芯片的制作。4对CE芯片与PCR芯片集成进行探索尝试,完成了PCR-CE芯片相关微器件的仿真,根据仿真结果,设计并制作了PCR-CE芯片,并探究了集成中出现的相关问题。5构建了集成光纤式CE检测系统,使用该系统,在130s内完成了FITC标记的三种氨基酸精氨酸、苯丙氨酸、甘氨酸混合物的分离。