肝豆状核变性基因外显子突变研究

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肝豆状核变性(hepatolenticuler degeneration,HLD)又称Wilson病,是铜代谢障碍导致铜在体内过量沉积所引起的疾病,发病率为1/10万至1/30万,是儿科较常见的遗传代谢病。本病为多系统累及疾病,临床表现多样,所以早期诊断较困难,易致误诊漏诊,导致治疗失败。目前的研究表明基因诊断将是实现早期诊断的较好方法,对HLD基因突变特点的研究将为基因诊断方法的建立确定理论基础。 目前已明确HLD基因定位于13q14.3,cDNA序列长4398bp,含有21个外显子及20个内含子,外显子长度从77bp-1234bp,大多为200bp左右。编码1465个氨基酸。其蛋白产物为一铜转运P型ATP酶。此酶主要有三个功能区:①金属离子结合区(metal binding site domain),位于N端,有6个与特定金属结合的氨基酸保守序列,长约30个氨基酸左右。②P型ATP酶功能区(也称高度保守区),包括磷酸酶活性区、磷酸化区,此区含有ATP酶磷酸化底物天冬氨酸残基及ATP结合区。③跨膜区(也称疏水区),包括6个跨膜螺旋区和1个双亲媒性区,间插于整个多肽链中。 浙江大学博土学位论文 截止目前,己有225种基因突变类型被发现,其中错义、同义或无义突变为144种类型,49种小缺失,12种小插入,3种调节基因突变,l种插入和缺失同时存在的突变,2种复杂重整突变以及门种剪接突变和 3种大片段缺失。国外学者的研究确定 14号外显子 1069密码子为白色人种 HLD患者高频突变点,其突变方式为 HI 069Q.对黄色人种HLD患者的初步研究表明其与白色人种外显子突变特点有明显差异,但目前缺乏对黄色人种患者 HLD基因 ZI个外显子的全面测序筛查,对此基因的突变形式、频度尚未有统一结论。这在理论上很大程度制约了HLD基因诊断方法的建立。 本研究对 HLD基因 ZI个外显子进行全面性测序筛查,探索浙江省汉族患者HLD基因突变数据,为HLD基因诊断方法的建立提供理论论据,为 HLD临床早期诊断作一初朱探索。 第一部分HLD基因外显子突变筛查 目的探索HLD基因外显子突变类型、分布、频度方法从30例浙江省汉族HLD确诊患者外周血中酚氯仿法制备DNA,针对刀个外显子设计引物,PCR扩增各外显子,琼脂糖水平电泳后在 紫外灯下割取目的条带回收PCR产物,Sanger双脱氧链终止法测定 DNA序列。 结果 4 浙江大学博士学位论文一、突变数目:共发现12种突变,其中5种为新突变,7种为己有 报道突变。二、突变类型:单碱基错配11种,小缺失1种。其中错义突变8种, 同义突变2种,调节基因突变2种。三、突变位置卜新发现突变): exon:*.123.119delCGCCG exon:-75A>C exon 2:”287A>Q D96G exon 2:巧88C>入D196E exonZ:”1216ThQ 5406A e-con3:*1366G>C,V456L exon 8 :二爿OC>Q u70L exon 8:2333G>T R778L exon 10:2495A>Q K832R exon 2975C>工*992L exon:3的SC>工S门665 exon巫7:3 646G>A,V1216 MM 四、突变频率:1216 T>T>G 26.7%,1366G>C 23.3%,2310C>G*8.3%, 2333G>T 28.3%,2*SA>G 25*%,2975C>T 26.7%,其余均为 散发突变,突变率(5%. 结论 一、-123-119dCICGCCG;287A>Q D96G;588C>A,D196E;1216T>Q 5 浙江大学博士学位论文 *06A;1366G>C,*456L为e D新发现的突变类型。二、浙江省汉族 HLD 患者热点突变区为 121 6T>Q 5406A; 1366G>C,V456*Z 2310C>Q*770*2 2333*>T*778*2 2495*>Q *832R;2975C>丁”92L.而exon 14的3207C>A,H1069Q未 发现有突变:这与白色人种患者突变规律有很大差异。三、浙江省汉族HLD基因外显于突变以点突变为主,偶见小缺失。 第二部分IILD基因外显子突变型与临床表型关系目的探索eD基因外显子突变与临床表型关系方法收集 3 0例浙江省汉族 HLD确诊患者临床资料(性别;发病年龄;临床分型人 将其与6个突变热点中的5个错义突变位点相比较。结果一、30例患者中,男15例,女15例。发病年龄4~14岁,平均8.96 士 1.87岁。肝型 18例,神经型 8例,其它型 4例。h、5个错义突变位点的突变患者与无突变患者临床表型差异无统计 学意义。结论未发现基因外显子突变类型与临床表型有相关性。
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