一、研究目的本研究对上海医学科学院建设模式进行研究,探索建立一条由政府主导、适合上海医学科技发展、高效资源整合的科技创新发展道路,为优化布局、突出重点、集中力量、发挥优势、实现跨越发展,为提升竞争力、扩大上海医学影响力提供决策依据。二、材料与方法本研究依据卫生政策学理论、组织理论、系统理论和资源配置理论等,运用卫生系统宏观模型确定本研究主要的政策问题和问题根源；通过文献查阅、专家访谈法收集国内外医学研究机构、医学科学院建设的有关情况；通过层次分析法、PEST分析法等对上海医学科学院建设方案进行选择与可行性论证。三、研究结果1、提出上海医学科学院建设方案根据目前国内主要医学科学院建设的模式,结合上海医学科学院的建设目标与定位以及上海医学研究机构现状,提出三个建设方案。方案一为传统组织模式；方案二为虚实结合模式；方案三为院校合一模式。对三个建设方案运用层次分析法进行分析,并对优选方案进行可行性论证。2、提出上海医学科学院建设设想上海医学科学院以严重危害人类健康的多发病、慢性病及疑难病为目标开展致病机制、诊断、治疗和预防等方面的研发,突破传统条块分割格局,整合政府各部门的卫生科技资源,创建一个以政府为主导、高效的科技创新研究管理平台,引导各方资源按需要和可能进行配置,强化行业管理。并通过若干阶段的努力,逐步建成具有国际水平和中国特色的临床和科研紧密对接的医学临床研究基地,实现具有国际水准的重大科研成果的产业化,成为中国医学基础研究及应用基础研究的中心,在全国处于领先地位,在国际上也具有一定的影响力。组织管理结构方面,上海医学科学院采取理事会领导下的院长负责制。设立转化医学中心、研究中心、项目管理中心、支撑平台、国际中心和行政管理中心6大部门。组织功能包括研究功能、分配功能和调控功能。在运行机制方面,借鉴美国NIH的管理经验,采取基金项目管理模式,分为院内项目、院外项目两大类。引入“专家评议”和“项目方答辩”机制,严格遵守“内部学术委员会审查、第三方专家评议、上级管理部门批准”三级遴选机制。按照“资源共享、优势互补、充分利用、避免重复”的原则,实现医科院内部各类资源共享,建立健全制约机制,对医科院及下属机构的运行进行常态监督。建立全方位的产、学、研、医有机结合机制,加快科研成果的转化化进程。推行稳定、灵活的人事制度、人才激励机制,营造良好和谐的竞争氛围。四、结论本研究针对上海医学科学院的建设,明确了上海医学科学院建设的目标、原则,机构组织架构与职能,并对运行机制有所考虑；对提出的虚实结合的建设方案进行可行性分析,并对可能存在的难点和困难进行了探讨,为上海医学科学院建设提供了一定的参考依据,对完善本市医学科技创新体系具有重要作用。