牛MyoD基因家族多态性及其与肉质性状的关联性分析

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英文中的“beef”指的是牛肉,其来源可以分为肉牛、奶牛、阉牛、断奶公牛、或是淘汰母牛,是中东地区(包括巴基斯坦和阿富汗)、澳大利亚、美国、巴西,阿根廷,和欧洲等首要的肉制品来源,并且在东亚部分地区和非洲也占据着相当重要的地位。牛肉占据世界范围内四分之一的肉制品来源,是世界上第三大普遍食用的肉源,仅次于猪肉(38%)和禽肉(30%)制品。有数字表明,美国,巴西和中国是世界上三大牛肉生产国。2011年人均统计,阿根廷人均年消费牛肉67.6kg,美国43.2kg,然而欧盟只有17.9kg。世界牛肉出口大国分别是巴西,澳大利亚和美国。近几年来,随着中国人民生活水平的提高和膳食结构的改善,全社会对牛肉的需求不断增加,对牛肉品质要求更高。目前,牛肉品质是制约中国肉牛业发展的主要问题之一。因此,利用现代分子生物学技术,例如DNA分子标记等来快速、准确地提高中国本地黄牛产肉量和牛肉品质非常重要。MyoD家族基因编码骨骼肌特异性转录因子,有高保守区的螺旋-环-螺旋结构,是影响牛肉品质和产量性状的关键基因,已经被认定为影响肉质性状的候选基因。本研究选取秦川牛、夏南牛、南阳牛、延边牛、郏县红牛和鲁西牛等6个群体为研究对象,运用PCR-SSCP技术和测序技术系统地寻找MyoD家族四个基因Myf3,Myf4,Myf5和Myf6的多态位点(SNP),以及对这些SNP与肉质性状的相关性分析。首先,SNP位点经由PCR和测序技术检测,然后通过SSCP技术分析整个群体的分布情况。本研究最后总共筛选到六个SNPs,分别是Myf3(166C>G), Myf4(959A>G),Myf5(1553A>C和1142A>G)和Myf6(131T>G和232A>C),其中Myf3(166C>G)为错义突变。关联分析结果表明,Myf5(1142A>G)和Myf6(131T>G)两种突变类型与肌内脂肪含量,大理石花纹,系水力,眼肌面积和嫩度有显著相关(P<0.05)。此外,Myf4基因的959A>G突变与肉的嫩度和系水力呈现极显著相关(P<0.01)。六个多态位点在六个牛品种的等位基因和基因型频率存在显著差异,经卡方检验,结果所有SNP位点基因型分布属于中度多态(0.25<PIC <0.5)。研究结果显示,1142A>G,959A> G和131T>G在上述试验群体中对肉质有潜在的影响,可以用作分子标记。同时,此研究结果也能够为肉牛的选育工作提供一定的理论依据。
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