论文部分内容阅读
本文分别运用RAPD及SSR分子标记技术对画眉笛鲷、金带笛鲷、金焰笛鲷、千年笛鲷和星点笛鲷等笛鲷属5种鱼的遗传多样性及其分子标记进行了研究。
从140个RAPD随机引物中筛选出扩增效果好的引物22个、从20对西大西洋笛鲷的特异性微卫星引物中筛选出扩增效果好的引物11对，分别用于5种笛鲷基因组DNA的扩增。扩增结果显示：
1．RAPD引物对画眉笛鲷、金带笛鲷，金焰笛鲷、千年笛鲷和星点笛鲷基因组DNA的扩增产物中，平均每个引物在每个个体上产生7~8个谱带，平均多态性位点比率（P）分别为：89.30％，86.70％，92.11％，86.47％和86.00％; 两个体间平均遗传距离（D）分别为：0.3431，0.2130，0.3121, 0.1825和0.1775；平均遗传多样性指数（Hi）分别为：0.1634，0.1095，0.1353, 0.1022和0.1024。和其它鱼类RAPD研究结果相比较可以看出，目前这五种鱼类都具有较丰富的遗传多样性。
5个种间的遗传距离(Dxy)按照由大到小的顺序排列分别为0.5032（金带笛鲷与千年笛鲷）、0.4926（金带笛鲷与星点笛鲷）、0.4408（画眉笛鲷与星点笛鲷）、0.4014（千年笛鲷与星点笛鲷）、0.4005 （画眉笛鲷与千年笛鲷）、0.3748 （金焰笛鲷与星点笛鲷）、0.3617（画眉笛鲷与金带笛鲷）、0.3426（金带笛鲷与金焰笛鲷）、0.3209（金焰笛鲷与千年笛鲷）、0.2878（画眉笛鲷与金焰笛鲷）。可见：在RAPD分析中，金带笛鲷与千年笛鲷之间的亲缘关系最远，画眉笛鲷与金焰笛鲷之间亲缘关系最近。
引物OPA8和OPP10都能一次性鉴别5种鱼。画眉笛鲷的特征谱带为OPA8-413bp，金带画眉笛鲷的特征谱带为OPP10-1042bp，褐带画眉笛鲷的特征谱带为OPP10-806bp，金带笛鲷的特征谱带为OPA8-140bp和OPP10-418bp，金焰笛鲷的特征谱带为OPA8-697bp和OPP10-526bp，千年笛鲷的特征谱带为OPA8-361bp和OPP10-449bp，星点笛鲷的特征谱带为OPA8-311bp和OPP10-599bp。这些谱带可作为5个种间的分子标记。
2. 在11对微卫星引物对画眉笛鲷、金带笛鲷，金焰笛鲷、千年笛鲷和星点笛鲷基因组DNA的扩增产物中,有效等位基因数分别为：1.9610，3.3793，3.2957，1.7893和3.6591；群体的杂合度（H）分别为：0.332，0.462，0.593，0.367和0.676；多态信息含量（PIC）分别为：0.302，0.438，0.554，0.332和0.641。可见，在5种鱼的SSR分析中，星点笛鲷的遗传多样性最为丰富。
5个种间的遗传距离（DA）按照由大到小的顺序依次为：0.4167（画眉笛鲷与千年笛鲷），0.4147（金焰笛鲷与千年笛鲷），0.4022（金带笛鲷与千年笛鲷），0.3748（金焰笛鲷与星点笛鲷），0.3612（画眉笛鲷与金带笛鲷），0.3527（千年笛鲷与星点笛鲷），0.3535（金带笛鲷与星点笛鲷），0.3516（画眉笛鲷与星点笛鲷），0.3470（画眉笛鲷与金焰笛鲷）， 0.2920（金带笛鲷与金焰笛鲷）。可见：在SSR分析中，画眉笛鲷和千年笛鲷间的亲缘关系最远，金带笛鲷和金焰笛鲷之间的亲缘关系最近。
微卫星引物对5种笛鲷基因组的扩增产物中，金带笛鲷的特征谱带为13 Prs229-115 bp；千年笛鲷的特征谱带为4 Lca43-212 bp、4 Lca43-240 bp和13 Prs229-288 bp；星点笛鲷的特征谱带为7Lca91-118 bp和19 Prs275-156bp，金带画眉笛鲷和褐带画眉笛鲷没有共同的特征谱带，但金带画眉笛鲷有一条特征谱带为7Lca91-111 bp。