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菌株AM-7161(AM-7161)能够产生具有强抗肿瘤活性的抗生素美达霉素(medermycin),作为一株重要的抗生素产生菌,迄今为止并未进行系统的分类鉴定,文献中仅根据形态认为是链霉菌(Streptomyces sp.AM-7161);med-ORF10是美达霉素生物合成途径中的一个重要基因,通过前期工作初步认为是一新型转录调控基因。本研究首先对链霉菌AM-7161进行分类鉴定,并利用生物信息学分析、基因互补和基因突变手段对med-ORF10展开功能研究,内容如下:
在不同条件下培养AM-7161并观察其培养形态、生长情况及产素情况,以及进行扫描电镜观察、革兰氏染色等,表明:AM-7161为典型链霉菌形态,但较一般链霉菌生长迅速;克隆其16S rRNA进行同源性分析及系统进化树分析表明:AM-7161与纳士维尔链霉菌xsd08147(Streptomyces nashvillensis strain xsd08147)序列同源性高达99%,确定其为纳士维尔链霉菌的一个亚种;
对Med-ORF10的一级、二级及三级结构进行生物信息学分析,结果显示:Med-ORF10为一个非常小的疏水蛋白分子,具有一个SH3(Src homolog3)基序和一个酪蛋白激酶2(CK2)基序;仅含一个NTF2(Nuclear transportor factor2,核运输因子2)结构域;其同源基因在芳香聚酮抗生素基因簇中广泛存在,推测是抗生素合成必须基因;与放线紫红素生物合成基因簇中的actⅥ-ORFA(编码新型正调控蛋白)同源性最近,推测二者功能一致:
对med-ORF10的功能进行体内遗传学分析:表明med-ORF10突变导致美达霉素的积累量和孢子产量下降:互补后发现美达霉素的积累和孢子产量均有一定程度的恢复,推测med-ORF10是美达霉素合成中的调控基因,同时有可能会影响到菌株的分化;
以上研究结果初步确定了美达霉素产生菌链霉菌AM-7161的分类地位,并且为美达霉素生物合成调控基因的研究奠定了良好基础。