近年来，转Bt玉米的全球大规模商品化生产蓬勃发展，转Bt玉米长期种植，Bt毒蛋白可通过根系分泌物、秸秆还田、残茬分解以及花粉飘落等进入土壤生态系统并积累和富集，可能会影响土壤微生物群落的组成和结构，改变土壤的微生物多样性。而土壤微生物是土壤生态系统中物质循环和能量转化的动力来源，温室和盆栽条件下很难反映土壤微生物系统的真实情况，因此，研究田间自然状态下转Bt玉米对土壤微生物群落及多样性的影响对Bt玉米的生态风险评价有着极为重要的意义。　　 本试验于2008年和2009年连续两年大田种植转Bt玉米和非Bt玉米，利用玉米苗期、拔节期、喇叭口期、抽雄期、抽丝期、乳熟期和完熟期的根际土壤及秸秆还田后不同时间采集的土样来分析大田自然状态下土壤微生物群落的变化，以及是否受到转Bt基因玉米Bt蛋白的影响。主要研究方法为PCR-DGGE分析法、Biolog法和传统的微生物分离培养法，酶联免疫法(ELISA)检测Bt蛋白。　　 1.通过PCR-DGGE法分析了Bt玉米和非Bt玉米对土壤微生物群落遗传物质的多样性影响是否有差别，随后的克隆和测序进一步确定了土壤微生物群落中的主要细菌种类及特异性的细菌种类。PCR-DGGE对细菌16s rRNA的V3区进行扩增结果表明在玉米各生育期根际土壤以及秸秆还田后土壤中的微生物DNA均得到了高效扩增，可分辨DGGE图谱条带在30-40条之间。不同生育期之间部分DGGE图谱之间有一定变化，在各时期Bt玉米与非Bt玉米土壤微生物群落的遗传物质组成没有明显差异，仅在个别时期内Bt玉米与非Bt玉米相比出现了或者缺失了某种特定的细菌种类。　　 对DGGE凝胶中检测到的细菌部分条带所代表的51条DNA序列进行系统分析显示，共涉及主要细菌门类有变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、厚壁菌门（Firmicutes）、芽单胞菌门（Gemmatimonadetes）、酸杆菌门（Acidobacteria）、拟杆菌门(Bacteroidetes)、热脱硫杆菌门（Thermodesulfobacteria）和硝化螺旋菌门（Nitrospirae）。　　 2.利用Biolog法研究Bt玉米和非Bt玉米对土壤微生物利用不同碳源能力的差别，以期反应土壤微生物的代谢功能活性是否受到Bt玉米的影响。检测结果显示，在玉米生育期和秸秆还田后的土壤微生物培养中，非Bt玉米的AWCD值和群落多样性指数(H，E，S)均普遍大于Bt玉米，表现出较强的代谢功能活性。Biolog所反映的细菌群落功能多样性受玉米基因型的影响较大。　　 3.利用酶联免疫法(ELISA)对2009年玉米生育期和秸秆还田后Bt蛋白在土壤中的残留和降解动态进行研究。检测结果证明，Bt玉米七个生育期内根际土壤的Bt蛋白随生盲期的变化差异较大，没有明显的规律性。Bt玉米秸秆分解释放的Bt蛋白在土壤中的降解前期十分迅速，但中后期十分缓慢。对Bt玉米秸秆地上处理和地下处理释放的Bt蛋白在土壤中的降解动态分别进行拟合证明，双指数模型要优于移动对数模型及指数模型,更符合实际降解动态。　　 4.运用传统方法对根际土壤细菌、真菌和放线菌以及七种功能细菌进行分离培养结果表明，各生育期内Bt玉米与对照相比根际土壤真菌无显著差异，但细菌在抽丝期，放线菌在苗期二者有显著差异。同种细菌功能群的数量变化在Bt玉米和对照各生育期内趋势一致，不同的菌群表现不同。整个生育期内3种群落特征参数均保持基本稳定，除乳熟期和完熟期外，Bt玉米根际微生物群落特征参数均高于对照。　　 综之，大田条件下转Bt玉米的种植对土壤微生物产生了一定的影响，如微生物代谢活性降低，个别生育期某特定细菌的出现或者缺失。但土壤微生物是一个复杂的系统，其与Bt玉米Bt蛋白的交互作用可能是一个长期渐进的过程，因而仍需要对其送行长期而细致的观察和试验。