核桃属是核桃科的骨干属,属内植物食用价值高。原产我国的有5个种,其中核桃和铁核桃富含碳水化合物、油脂、维生素和矿物质,已有近500年的栽培和育种历史。自二十世纪七十年代起,超过300个品种从核桃产区培育和驯化。麻核桃即是一种工艺美术雕刻材料也是老年人活络筋骨的玩物,其商业价值不断得到提升。近年来的种质资源交换增加了我国核桃属植物的种数。随着核桃属植物大规模商业生产和开发以及相关种的品种选育、鉴定及种资源的收集和保护工作的深入研究,形态描述、地理来源以及同工酶等方法由于自身的局限已难以满足核桃属植物的研究、利用和商业开发的需要,分子标记技术为上述工作的深入开展提供了新的工具。微卫星分子标记,又称简单重复序列标记有着高的多态性和同源性以及共显性遗传的特点,广泛应用于木本植物研究。最近黑核桃与山核桃的微卫星标记已被开发和利用。微卫星标记在其它木本植物中的成功转移是我们运用黑核桃微卫星引物分析核桃属近缘种的理论依据。选择17对扩增条带清晰、多态性高的黑核桃引物分析山核桃属4个样品和核桃属41个样品,结果显示微卫星侧翼序列在核桃属内种间具有高的保守性,微卫星的多态性明显高于以往传统标记。但是微卫星在近缘种种下分析结果也表明多态性信息含量(PIC, polymorphism information content)、期望杂合度和观察杂合度等都比黑核桃低。麻核桃与核桃、核桃楸共享等位基因数多,以及低的遗传距离的高的相似系数都支持麻核桃是核桃与核桃楸的天然杂交种;铁核桃在3个位点上存在特异条带,聚类分析结果也显示与核桃平型,应将其作为核桃组下的一个独立种;核桃种内各品种间较小的相似性和较大的遗传距离都表明我国是核桃的源产地,且在我国境内多地起源。最后,本实验的样本数和微卫星引物位点数量较为有限,分析结果仍需增加样本或微卫星位点进一步确定。