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红嘴相思鸟（Leiothrix lutea）是雀形目（Passeriformes）噪鹛科（Leiothrichidae）鸟类,也是我国的传统观赏鸟类。2021年被列为国家II级重点保护野生动物。我国一直存在红嘴相思鸟非法贸易现象,这十分不利于红嘴相思鸟野生种群的保护;此外,由于红嘴相思鸟的贸易信息数据匮乏,不利于从源头控制非法贸易和非法猎捕,也不利于监管部门开展野外种群保护和制定相应管理措施。基于此,本研究通过传统调查法结合全基因组重测序技术（SNPs标记）和线粒体COI/Cytb标记对我国红嘴相思鸟的贸易路线进行追踪,为红嘴相思鸟野生种群保护和非法贸易控制提供基础资料。研究结果如下:1.2019年利用传统调查方法对我国红嘴相思鸟野外种群分布现状及其贸易现状进行了调查,结果显示,调查的16个省份16个鸟市均存在红嘴相思鸟贸易现象,市场上的贸易个体主要来源于云南、广西、四川、贵州、陕西、江西、河南和安徽8个原产地,占已知的红嘴相思鸟野外分布省份数量的33%。不同市场红嘴相思鸟的具体来源为:上海的来源于陕西、四川和安徽;广东的仅来源于广西;浙江、河南的来源于河南和广西;重庆、湖北、山东和江苏的仅来源于四川;四川的来源于四川和贵州;甘肃的来源陕西和四川;安徽的来源于安徽和广西;而广西、江西、陕西、贵州和云南市场仅来源于本地。总的来看,除了云南和江西只发现省内贸易,其余均存在省外贸易,且广西、四川和陕西的贸易量大,是红嘴相思鸟国内贸易重要的源头。2.对141个红嘴相思鸟样本（包括18个野生样本和123个市场样本）进行全基因组重测序,获得的数据经质控和比对后,将比对覆盖率低的样本5个舍弃,最终获得了136个样本的21,077,599个SNPs标记。对该SNPs标记集进行筛选过滤,获得了的8,231,864个高质量SNPs标记用于遗传多样性分析、主成分分析（PCA）和遗传结构分析（STRUCTURE）。遗传多样性分析发现红嘴相思鸟群体的观测杂合度（Ho）为0.1045-0.5615,期望杂合度（He）为0.1026-0.4977,与同科的画眉（Garrulax canorus）、玉山噪鹛（G.morrisonianus）和黄痣薮鹛（Liocichla steerii）,或不同科的震旦鸦雀（Paradoxornis heudei）和红嘴牛椋鸟（Buphagus erythrorhynchus）相比,其均显示出较低的遗传多样性。根据PCA和STRUCTURE结果对市场样本进行溯源分析,认为某市场红嘴相思鸟的贸易来源应与其原产地聚集最近且遗传结构最相似,根据该原则可知市场样本没有与云南、西藏的野生样本聚集在一起,说明此次采集的红嘴相思鸟市场样本并非源于云南和西藏,与传统调查方法一致,并推测出不同市场红嘴相思鸟的贸易来源,如上海的来源于湖北;广东的来源于广西和四川;广西的来源于广西;浙江、重庆、河南和甘肃的来源于四川和陕西;四川的来源于贵州;湖北的来源于湖北;江西的来源于江西和湖北;安徽的来源于安徽和四川;陕西的来源于陕西;贵州的来源于贵州。即市场样本的贸易来源为江西、安徽、广西、湖北、四川、贵州和陕西7个原产地。3.对139个红嘴相思鸟样本（包括18个野生样本和121个市场样本）进行直接测序,获取COI基因和Cytb基因序列,并将两基因联合构建系统发育,结果发现大多数的市场样本都能与已知来源野生样本聚支,通过线粒体标记获得的红嘴相思鸟贸易个体可能源自广西、湖南、湖北、贵州和四川,具体为:上海市场的来源于广西、湖南、四川和贵州;广东的来源于广西、湖北、湖南、四川和贵州;广西的来源于广西、湖南、四川和贵州;重庆的来源于广西;四川的来源于广西和贵州;甘肃的来源于广西和贵州;河南的来源于湖北和贵州;湖北的来源于广西、四川和贵州;江西的来源于湖南;安徽的来源于广西;陕西的来源于广西、湖南、四川和贵州;贵州的来源于广西和贵州;仅浙江的没有明确来源。总的来看,广西、四川和贵州原产地是红嘴相思鸟的重点贸易来源。从系统发育进化树上可知市场样本没有来源于云南的个体,与利用传统调查方法和全基因组重测序标记法获得的结果一致。4.STRUCTURE结果显示,当红嘴相思鸟群体被划分为4个亚群时,其遗传结构与PCA结果较为一致,云南和西藏的野生样本与其他地区明显不同。野生红嘴相思鸟西藏和陕西具有特殊的遗传结构,很可能是该物种的重要起源地,而其他地区则具有多个基因来源,历史上应存在广泛的基因交流。传统调查方法、线粒体COI/Cytb标记法和全基因重测序SNP标记法均得出了所有红嘴相思鸟市场样本没有来自云南的结果,但前两种方法在贸易路线追踪中具有一定的缺陷,传统方法无法识别二次贸易来源地和原产地,线粒体标记法的精度不足50%,难以真实反映出实际贸易路线。红嘴相思鸟贸易来源及路线的追踪以全基因重测序SNP标记法为主,传统调查法为辅,最终形成多条贸易路线:如广西的到广东;湖北的到上海和江西;四川的到上海、浙江、重庆、河南、甘肃和安徽;陕西的到浙江、重庆、河南、甘肃和四川;贵州的到四川。结合贸易范围,可知四川和陕西是重点贸易源头,相关部门在大力打击红嘴相思鸟非法贸易时,可更有方向地对这些重点源头省份进行控制,以保护红嘴相思鸟野外种群。