本研究以层次分析模型为基础，构建了以鸟类保护为目标的湿地生态功能评价指标体系。将研究区划分为沼泽、人工林、藕塘、鱼塘、耕地、果林类等六类价单元，并结合研究区的特征，以鸟类作为主要保护对象，兼顾湿地的功能，设立水面占比、植被盖度、生物多样性、鸟类食源丰富度、鸟类筑巢可能性、人工干扰程度六个指标，通过分级赋值以及层次分析法（AHP）对不同评价单元进行了重要性评估。并以合阳黄河湿地为对象，开展了自然保护区与风景名胜区重叠区生态功能评价，并根据生态功能评价结果与不同频率洪水淹没区叠加为方法，设定了三个生态保护红线划定方案，通过比较不同方案的特点，确定了生态保护红线划定方案建议方案，并结合风景名胜区功能区划，提出了生态保护红线的管理策略。主要研究结论如下：
　　（1）在对不同评价单元的不同指标进行分析时，发现沼泽除了水面占比以外，在植被盖度、生物多样性、鸟类筑巢可能性、鸟类食源丰富度上都是得分最高的；人工林从植被盖度、生物多样性、鸟类筑巢可能性和人工干扰强度上的得分仅次于沼泽；藕塘底泥富含有机质，在植被盖度和生物多样性上的得分比较高；耕地、果林和鱼塘综合得分比较低。
　　（2）通过分级赋值综合评价的方法，可以得到各类评价单元的生态功能由强到弱依次为：沼泽、藕塘、人工林、鱼塘、果林和耕地。即自然沼泽地为生态功能极重要区，藕塘、人工林、鱼塘为生态功能重要区、果林、耕地为生态功能一般重要区。
　　（3）结合不同频率的洪水泛滥区进行了生态红线划定的研究，给出了3个划定方案，经研究发现将五年一遇的洪水泛滥区和生态重要性评价极重要区划入生态红线相比于其他方案最能够发挥湿地的生态价值。
　　（4）结合红线划定方案与风景区区划，黄河湿地保护区核心区和缓冲区应该禁止进行一切和生态旅游相关的开发与建设工作；抽黄工程观光区项目尽量以教育、文化、参观为导向，避免建设大型的酒店、餐厅等大型建筑；洽川瀵泉游憩、田园生态体验区和旅游城镇服务片区可以建设更多元、时尚的符合人民日益增长的文化需求的特色项目，但是在开发时应尽量远离划入红线的区域。