热应激对高产荷斯坦泌乳牛造成诸多不利影响:生理上,表现出体温、呼吸频率、出汗率上升以及内分泌系统变化;生产繁殖上,采食量、产奶量、繁殖力均有所下降;健康上,乳房炎、酮病等发病率增加等。仅因产奶量下降,对奶业已造成巨大的经济损失,在平衡育种理念下,提高奶牛热应激耐受性至关重要,可使得牛群对未来气候有更好的适应性;常规育种首先需要了解性状的群体遗传参数,且在此基础上挖掘遗传标记可用于标记辅助选择。因此,本研究以热应激的生理反应指标:直肠温度、呼吸评分以及流涎指数为研究对象,主要内容及研究结果如下:1.收集北京地区12,541头荷斯坦牛实测直肠温度、呼吸评分以及流涎指数数据,采用多性状动物模型对热应激条件下泌乳牛三项生理指标进行遗传评估,包括方差组分估计、遗传参数估计和育种值预测,同时对主要性状的遗传趋势和遗传相关进行了分析。结果显示,三项生理指标遗传力范围0.062-0.117,属于中低遗传力,重复力范围0.657-0.773,遗传相关范围0.662-0.843,属于中高遗传相关,三项生理指标均可作为奶牛热应激反应的量化指标。2.虽然没有对奶牛热应激生理指标进行直接选择,但北京地区使用的1990年至2017年出生荷斯坦牛的热应激生理指标估计育种值(EBVs)均呈上升趋势,建议针对气候炎热地区牛群的选育体系关注奶牛热应激反应相关指标,为降低热应激损失的差异化育种打下基础;3.利用Farm CPU对2,598头荷斯坦牛直肠温度、呼吸评分以及流涎指数EBVs进行全基因组关联分析(GWAS),结果找到15个在基因组水平上(α=0.05)显著的SNPs位点,分别位于普通牛12条染色体上,附近(300kb内)相关基因19个,其中CLCX13、SLBP和PRKCE基因功能分别与免疫、繁殖以及脂质氧化代谢有关,可做为热应激相关候选基因。本研究从奶牛应对热应激的生理指标入手,首次获得中国荷斯坦牛呼吸评分和流涎指数的群体遗传参数,尝试利用GWAS挖掘与奶牛热应激反应的相关遗传标记,为从遗传育种角度制定选育策略提高奶牛热应激耐受性提供理论参数。