NGS在胃癌临床诊疗中的应用及预后分析

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背景与目的胃癌是世界上常见的恶性肿瘤之一。由于早期胃癌的临床病征不明显,多数患者在确诊时已是进展期,导致晚期胃癌患者的预后较差,5年生存率仅不到10%。目前已有的研究对胃癌发生转移的机制以及不良预后相关影响因素仍不明确,其主要原因是由于恶性肿瘤的高度异质性。肿瘤的异质性不仅体现在年龄、性别、地域等方面,也可以体现在胃癌基因分子水平上的差异。因此从分子水平上挖掘与胃癌预后相关的基因,对患者的临床治疗以及预后判断有重要意义。在日益提倡癌症个体化治疗与精准医疗的时代,传统的组织病理学分型在反映肿瘤的内在特征方面受到多方面的限制。所以将胃癌按照基因分型详细划分亚型种类,可以为胃癌患者提供个体化、精准化诊疗。随着生物技术发展,二代基因测序技术(Next Generation Sequencing Panel Test,NGS)在临床实践中的应用也开始普及。根据NGS检测结果,按照基因分子突变特征将胃癌分成多种亚型,以用来指导疾病的早期诊断和个体化治疗。更重要的是,在诊断多个不同基因参与的疾病方面,NGS比传统的单基因序列分析具有更高的准确率。目前,胃癌的分子分型在临床中的应用还很有限,这一现状使临床医生为胃癌患者选择个体化治疗方案的依据极为有限,难以大幅提高胃癌的治疗效果。因此,本文旨在分析在NGS技术检测下,胃癌患者的相关基因与其临床病理特征及生存期的相关性,以此研究基因突变在胃癌的发生发展、临床诊疗及预后分析的意义。资料与方法回顾性分析2018年2月至2019年4月期间在郑州大学第一附属医院行胃癌根治116例手术患者作为研究对象,术后病理明确且行NGS检测。选取116例患者的基因检测结果,将基因按照功能不同分成四组,分析基因突变与临床病理特征及基因表达的差异性。按照基因突变型、野生型分组分别对胃癌患者的年龄均值、区域淋巴结阳性率、肿瘤最大径均值进行t检验,对性别、吸烟、饮酒、是否神经及脉管侵犯进行χ2检验,对分化程度、肿瘤分期进行秩和检验,分析手术后患者的无病生存期(Disease-freesurvival,DFS),采用Kaplan-Meier描绘生存曲线,P<0.05认为差异有统计学意义。结果1.TP53基因突变组与野生型组在性别上有差异,差异有统计学差异(P<0.05);TP53基因在年龄、吸烟史、饮酒史、肿瘤分化程度、TNM分期、淋巴结阳性率、神经及脉管是否侵犯上差异均无统计学意义(P>0.05);ERBB2基因突变组与野生型组在年龄、性别、吸烟史、饮酒史、分化程度、TNM分期、淋巴结阳性率、神经脉管是否侵犯上的差异均无统计学意义(P>0.05)。2.CYP2D6基因突变状态在淋巴结阳性率、是否神经侵犯上差异具有统计学意义(P<0.05),CYP2D6基因在年龄均值、性别、吸烟史、饮酒史、肿瘤分化程度、TNM分期、是否脉管侵犯、肿瘤最大径上无统计学意义(P>0.05)。CYP3A5基因突变状态在吸烟史、饮酒史、淋巴结阳性率、神经及脉管侵犯上的差异均具有统计学意义(P.<0.05),CYP3A5基因在年龄均值、性别、肿瘤分化程度、TNM分期、肿瘤最大径上均无统计学意义(P>0.05)。CDA基因突变状态在饮酒史上的差异具有统计学意义(P<0.05),CDA基因在年龄均值、性别、吸烟史、肿瘤分化程度、TNM分期、是否神经及脉管侵犯、肿瘤最大径上无统计学意义(P>0.05)。3.ERCC2基因在年龄、性别、吸烟史、饮酒史、肿瘤分化程度、TNM分期、淋巴结阳性率、是否神经及脉管侵犯、肿瘤最大径上差异无统计学意义(P>0.05)。XRCC1基因在年龄、性别、吸烟史、饮酒史、肿瘤分化程度、TNM分期、淋巴结阳性率、是否神经及脉管侵犯、肿瘤最大径上差异无统计学意义(P>0.05)。4.MTHFR基因在年龄均值上有差异,差异具有统计学意义(P<0.05),MTHFR基因在性别、吸烟史、饮酒史、肿瘤分化程度、TNM分期、淋巴结阳性率、是否神经及脉管侵犯、肿瘤最大径上差异无统计学意义(P>0.05)。NQO1基因在年龄均值、性别、吸烟史、饮酒史、肿瘤分化程度、TNM分期、淋巴结阳性率、是否神经及脉管侵犯、肿瘤最大径上差异无统计学意义(P>0.05)。5.116例患者的中位DFS为19个月。TP53基因在两组的DFS具有差异,差异具有统计学意义(P=0.03);ERBB2基因在突变组和野生型组的中位DFS的差异无统计学意义(P=0.40)。CYP2D6基因、CYP3A5基因、CDA基因的突变状态在DFS上差异均无统计学意义(P>0.05)。ERCC2基因、XRCC1基因的突变状态在DFS上差异均无统计学意义(P>0.05)。NQO1基因在两组的DFS具有差异,差异具有统计学意义(P=0.03);MTHFR基因在两组的DFS的差异无统计学意义(P=0.59)。结论1.在原癌基因、抑癌基因中,TP53基因的突变率在性别之间不同,男性患者的突变率高于女性患者。2.在药物代谢酶中相关基因中,CYP2D6基因突变组与野生组中患者的淋巴结阳性率不同,突变组高于野生组;突变率在神经是否侵犯之间不同,未发生侵犯的突变率高于发生侵犯的突变率。CYP3A5基因突变组与野生组中患者的淋巴结阳性率不同,突变组高于野生组;突变率在患者的吸烟史、饮酒史、神经及脉管侵犯上有不同,阴性因素组的突变率均高于阳性因素组。CDA基因的突变率在饮酒史不同,饮酒患者的突变率高于无饮酒史的患者。3.在DNA修复相关基因中,ERCC2基因及XRCC1基因的突变组与野生组均尚不能认为在患者的年龄均值、淋巴结阳性率、肿瘤最大径存在不同;ERCC2基因及XRCC1基因的突变组与野生组均尚不能认为在患者的性别、吸烟史、饮酒史、肿瘤分化程度、TNM分期、是否神经及脉管侵犯等临床病理因素的突变率不同。4.在参与生化反应相关的基因中,MTHFR基因突变组与野生型组的年龄均值不同,野生组高于突变组。NQO1基因突变组与野生组尚不能认为在年龄均值、淋巴结阳性率、肿瘤最大径存在不同;NQO1基因突变组与野生组尚不能认为在性别、吸烟史、饮酒史、肿瘤分化程度、TNM分期、是否神经及脉管侵犯等临床病理因素的突变率不同。5.胃癌患者预后分析中,TP53基因野生组预后优于突变组,NQO1基因的突变组预后优于野生型组;其余基因尚不能认为突变组与野生型组的预后存在不同。
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