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商品型生态农业建设是一个不断改善农业生态经济系统耦合协调关系，实现农业生态-经济、资源-产业系统之间协调统一的过程。黄土高原退耕还林工程的实施，通过改变土地利用结构、增加生态资源量改善了区域生态系统，同时影响了农业产业结构和布局以及农业经济的发展，对商品型生态农业的发展产生了重要作用；商品型生态农业的发展对退耕还林工程系统具有一定的反馈作用，二者相互耦合并融为一体，促进了区域生态经济复合系统的发展演变。商品型生态农业与退耕还林工程系统耦合关系的演变态势和农业生态经济系统耦合态势的演变过程，既是退耕还林工程实施以来商品型生态农业建设效果的表现，也是对商品型生态农业实施效果评价的核心；对于揭示退耕还林工程驱动下的农业生态经济系统的运行规律及其本质具有重要的现实意义。因此，本文选择典型区域安塞县作为研究区域，通过分析退耕还林工程与商品型生态农业系统的互动关系，明确其表征的指标体系；分析评价商品型生态农业与退耕还林工程系统耦合态势的演变过程；判定商品型生态农业自退耕还林工程实施以来经历的阶段，为进一步巩固退耕还林成果，推动区域商品型生态农业快速发展，实现农业生态经济系统的协调可持续发展方案的制定提供参考。主要结论如下：（1）退耕还林工程对商品型生态农业系统的影响，主要表现为对农业资源和产业系统的正的驱动过程——促进了农业资源结构的优化和产业结构的调整，商品型生态农业迅速发展；局部负作用——造成了农业资源的闲置和浪费。2009年安塞县农林牧用地中林草地比重较1998年增长了11.3%，耕地面积逐渐减少，农业资源结构得到优化；农林牧副产业结构不断调整，农业主导产业由退耕前的种植业、畜牧业转变为退耕后的棚栽业、林果业等，商品型生态农业快速发展；但也造成了农业资源的闲置和浪费，2008年实际畜牧量仅占草地理论最适承载量的19.36%，产业与资源相关性降低，一定程度上制约了商品型生态农业的潜力实现率。反过来，商品型生态农业的发展一定程度上巩固了退耕还林成果。（2）从商品型生态农业与退耕还林工程系统以及农业生态与经济系统两个层次建立耦合度模型，对商品型生态农业系统与退耕还林工程系统的耦合态势及其演变进行了分析，结果表明：商品型生态农业与退耕还林工程系统的耦合态势演变过程可以划分为4个阶段：商品型生态农业与退耕还林工程系统协调化发展阶段（Ⅰ），过度退耕情况下商品型生态农业发展阶段（Ⅱ），过度退耕限制商品型生态农业发展阶段（Ⅲ），限制商品型生态农业发展速度以促进退耕还林系统快速发展阶段（Ⅳ）；其中，阶段Ⅱ可能会短期出现，而阶段Ⅲ和阶段Ⅳ一般只是理论上的结果。1999～2010年，安塞县商品型生态农业与退耕还林工程系统耦合关系先后经历了商品型生态农业与退耕还林工程系统协调化发展阶段和过度退耕情况下商品型生态农业发展阶段，目前处于过度退耕情况下农业经济系统发展速度下降时期，过度退耕和农业产业—资源局部相悖态势导致系统耦合协调程度减弱，农业生态经济系统的可持续协调发展潜伏着一定危机。（3）在评价商品型生态农业与退耕还林工程系统的耦合关系的基础上，依据农业生态-经济系统和产业-资源子系统两个层次的耦合协调度判定标准，初步确定了商品型生态农业3个阶段的定量判定标准：Ⅰ.基本结构建造阶段——农业生态-经济系统耦合协调度0＜D1≤0.8，农业产业-资源子系统耦合协调度0＜D2≤0.7；Ⅱ.完善农业系统循环阶段——农业生态-经济系统耦合协调度0.8＜D1≤0.9，农业产业-资源子系统耦合协调度0.7＜D2≤0.9；Ⅲ.系统“加环”阶段——农业生态-经济系统和产业-资源子系统的耦合协调度0.9＜D≤1.0。在此基础上，判定了退耕还林工程实施以来安塞县商品型生态农业经历的阶段及其现状特征，结果表明：退耕还林工程实施以来，商品型生态农业建设成效显著，系统综合发展指数由1999年的0.2752增长到2010年的0.7195。1999-2009年，安塞县商品型生态农业建设先后经历了第Ⅰ阶段的生态系统结构建造时期和农业产业结构调整时期，生态系统的改善和农业产业结构的调整和发展促进了农业经济的快速增长；2010年，开始向完善农业系统循环阶段（阶段Ⅱ）过渡；目前，农业产业-资源子系统的耦合协调关系明显滞后于农业生态-经济系统，相关产业的发展并未合理有效地利用农业资源，农业产业与资源的局部相悖态势制约了商品型生态农业系统综合发展水平的快速提高。（4）基于耦合度模型和耦合协调度模型两种方法下的安塞县商品型生态农业实施效果评价的研究结果表明，退耕还林工程实施以来，安塞县商品型生态农业在建设过程中凸显的主要问题是：农业生态资源的闲置和浪费，过度退耕的负面效应显现，农业后续产业链以及特色农产品品牌发展缓慢等。为此提出了促进农业生态经济系统协调可持续发展的路径和策略：首先在巩固退耕还林成果的基础上，发展林草及其相关产业，提高农业资源的有效利用率，大力培育后续产业，优化农业产业结构，完善商品型生态农业系统链网结构；其次要有效保护耕地资源，防止过度退耕现象的进一步发展。