背景与目的：公立医院内部控制是公立医院为了实现其内控目标而制定和执行的一系列方法和措施。医院财务舞弊问题及一批批贪官的“落马”事件,充分表明了虽然公立医院这类非营利组织并不像企业那样面临着高频破产的风险,但其所存在的财务困境与经营风险同样不可忽视。目前,以公立医院为代表的非营利组织日益成为内部控制的重点研究对象,但其主要研究仍集中在医院部分业务或整体内部控制存在缺陷及对策建议层面；公立医院内部控制体系建设方面的研究则相对较少,并且以对企业内部控制体系的照搬照抄或根据已有COSO五要素设计的内部控制框架为主,无任何可以信赖的方法和原则作为依据。正是基于此,本研究以公立医院主要经济活动的内部控制作为切入点,系统介绍了公立医院内部控制框架设计的原则及方法,并对内部控制的核心,公立医院主要经济活动的具体控制措施进行了分析和归纳。方法：本研究以北京市卫生局直属公立医院为依托,通过调查、借鉴相关文献资料,了解公立医院内部控制的现状及存在问题；并通过组织领域专家研讨会的方式,对卫生局直属公立医院的内部控制制度进行了深入探讨,进一步明确公立医院主要经济活动各业务流程的风险及内部控制的目标,提出了内部控制框架设计的基本原则及具体方法,最终形成了基于两个层面的公立医院内部控制框架。结果：第一,探讨了公立医院内部控制的现状及存在问题。研究从C0sO内部控制报告五要素的角度分别就公立医院内部控制环境、风险评估、控制活动、信息与沟通、监督等方面所存在的问题进行了论述。第二,分析了公立医院的经营目标,以此为前提建立了公立医院的内部控制目标,并在此基础上形成公立医院队部控制两个层面的要素设计。本文从公立医院的两大经营目标出发,提出公立医院内部控制的主要目标包括了医疗服务的效率和质量、资产的安全完整和有效利用、法律法规的遵循以及会计和管理信息的真实有用这四个方面,根据目标,结合控制论原理构建了公立医院内部控制构成要素的第一层面,包括了控制环境、控制活动、监督这三部分；同时对这三个构成要素进行了深入分析,分解出公立医院内部控制构成要素的第二个层面,其中控制环境包括了产权关系与治理结构,组织结构与组织文化,信息和沟通,人力资源政策；控制活动部分包括了风险评估和控制方法及措施；内部控制监督部分包括了评价与反馈两部分。第三,通过与企业内部控制活动设计的对比,探讨了内部控制活动设计的原则和方法,并完成了预算控制,收入控制,支出控制,货币资金控制,存货控制,固定资产控制,基建工程项目控制,对外投资控制,以及经济合同控制这九项具体业务的控制设计。