本研究以从我国少数民族地区自然发酵酸马奶中分离、筛选得到的一株益生乳酸菌Lactobacillus casei Zhang为研究对象,以普通MRS培养基和碳源限制性MRS培养基作为连续培养的基质,以1%接种量每24h传代一次,每个传代周期菌株生长log2100≈6.64代,分析其在长期连续传代过程中的表型特征、益生特性及基因组水平的变化,对该菌的稳定性做出系统评价。研究结果显示,在连续培养2000代期间,L. casei Zhang的细胞和菌落形态没有变化,且连续培养并不会改变培养周期内总生物量和周期末活菌数；对各种碳水化合物的代谢能力也没有改变,且菌种活力保持良好。益生菌L. casei Zhang在两种培养基中连续培养2000代期间生长情况持续较好,具有非常稳定的表型特征,没有发现衰退现象。对益生菌L. casei Zhang的基本益生特征的跟踪分析表明,L. casei Zhang对pH2.5的人工胃液以及pH8.0的人工肠液耐受能力、胆盐的耐受能力无变化,反应益生菌粘附性的自凝集率也没有受连续培养代数及MRS培养基种类的影响而发生变化,益生菌L. casei Zhang的这些益生特性在连续培养2000代期间均较稳定。利用Miseq高通量测序平台,在对L. casei Zhang在两种培养基中连续培养至1000代和2000代的基因组重测序分析,共发现44处SNP突变位点和23个InDel突变位点。碳源限制性MRS培养基中1000代中发现SNP突变位点平均数量少,多数为高频突变,一旦建立,将稳定遗传,显示经历了选择压力；在2000代菌株中高频率SNP突变位点增加2个,表明此时选择压力已经下降,出现种群分化现象。同时,在两种培养基中L. casei Zhang传代菌株中均发现在基因rpoC中出现了高频率突变,据此推测L. casei Zhang在不同培养条件下发生着一种趋同进化,高速生长的细菌占有竞争优势。总体而言,益生菌L casei Zhang的基因组在两种培养基中连续传代培养2000代过程中高频突变较少,并且1000代低频突变在2000代有消失的迹象,可能菌株已适应在这一类似的环境,并在这一环境中可长期生存。从基因组水平编码基因的突变水平证实了L. casei Zhang在长期传代培养过程中具有稳定表型特征及益生特性。综合以上研究揭示益生菌L. casei Zhang在连续培养时具有良好的遗传稳定性,是一株不可多得的可安全使用的益生菌菌种。