本论文工作是结合国家十五科技攻关项目“自动生化分析仪器的研制”课题(课题编号：2004BA706805)开展的。全自动生化分析仪是临床诊断中的重要仪器，主要用于测定人体体液中的各种生化指标。东软集团研制的NSA-800全自动生化分析仪，是我国首台大型全自动生化分析仪。 本文首先论述了NSA-800全自动生化分析仪，该机采用的是多单片机控制系统。本文提出了一种新的控制方案，用一片ARM和一片FPGA代替原机的控制系统，在保留原机外围电路不变的情况下，实现了生化分析仪的控制系统。 控制系统设计包括硬件设计和软件设计两部分。硬件设计主要有芯片的选择和电路原理图的绘制。软件设计主要有ARM的初始化、并口通信协议、串口通信、模数转换程序等；重点论述了步进电机的加减速控制曲线，并用状态机来实现驱动脉冲的产生，实现了对步进电机匀速运动和变速运动的精确控制。 最后简单论述了控制系统的调试。调试结果表明：基于ARM和FPGA的控制系统是合理的，可行的，为今后控制系统的升级提供了一种理想方案。