世界上现有的山茶属植物分类系统之间存在着很多分歧，其中红山茶组植物的分类问题是其争论的焦点之一，单纯地依靠表型性状分类是其产生分歧的主要原因。以山茶属红山茶组植物花瓣红色素(花色素及其苷)为标记的化学分类方法为红山茶组植物的分类及其系统发育提供了新的证据，其在茶花品种群的划分及花色辅助育种上也具有重要的指导意义。 在进行色素分析时，研究确定山茶具有代表性的采样期为花朵的半开期至盛开期。采样方位及位置为朝阳方向、树体中部以上的外围花朵。近距离条件下的鲜花瓣可直接用于浸提色素。远距离条件下，花瓣可用沸水处理后进行硅胶干燥保存或者用硅胶直接保存，均可适用于色素研究。 本文完善了山茶薄层层析(硅胶G板，新华3号层析滤纸)作为山茶花瓣色素组分定性分析的辅助实验方法，以及系统建立了红山茶物种与栽培品种的红色素、非金花茶起源的茶花栽培品种黄色素的高效液相色谱HPLC分析方法。红山茶属植物13种重要色素的HPLC出峰顺序为(Cy3G5G＜Pg3G5G)＜(Cy3Ga＜Cy3GG＜Cy3G＜Pn3G)＜(Dp＜C7＜Pn＜Mv)＜(Cy3G5GpC＜Cy3GCwC＜Cy3pCG)。从美国牡丹花瓣色素粗提物中，采用MCI及sephedex柱两次分离纯化，成功分离获得了一种纯度达92％的花瓣色素，基本达到了目前商品标准样品的纯度。 利用紫外-可见分光光度法以及高效液相色谱法，对非金花茶起源的栽培品种‘黄海南宝珠’花瓣中的类黄酮和类胡萝卜素进行了分析比较。结果表明‘黄海南宝珠’花瓣中的主要呈色色素可能是一种不同于金花茶花瓣黄色呈色色素的物质，这为今后开展非金花茶起源的黄色花瓣栽培新品种培育提供了新的启示。 在对15个山茶物种和100个栽培品种的200多份样品进行HPLC分析后，共检测到花瓣色素100多种。其中，色素成分相对含量高于1％的色素有31种，占30％左右，其余70％的色素成分均为相对含量低于1％的微量成分。 对浙江红山茶16株实生起源成龄树和张氏红山茶2盆嫁接苗进行了色素株间差异研究。结果发现浙江红山茶重要色素的相对含量在株间存在一定差异，但其未达到统计学显著水平。其中Cy3Ga相对含量平均值为36.77％(变异幅度为20.3％-62.24％)，Cy3G相对含量平均值48.72％(变异幅度为23.07％-66.3％)，Cy3Ga和Cy3G两色素之和的平均值为85.49％(变异幅度为76.24％-91.75％))；而张氏红山茶色素含量在盆间的差异极大。在盛花期，张氏红山茶2主要色素Cy3Ga和Cy3G在盆间分别相差72％和31％；3种次主要色素的相对含量分别相差100％、200％和60％。 通过对13个物种进行主成分分析及聚类分析，可将这些物种划分为两大类三个类