自改革开放以来,我国制造业持续高速发展,已成为世界制造业第一大国。在我国制造业发展过程中,学术界对于产业结构问题进行了广泛的研究,主流观点认为由于我国制造业受产业扶持与引导政策影响较深,各地区纷纷招商引资,发展类似产业,区域间产业结构趋同现象明显,但这个问题并不像目前大多数研究认为的那样。随着时间的推移和产业的细分,市场力量推动要素流动与产业发展,项目选择和区位决策的盲目性逐渐减少,地区间结构差异呈现扩大趋势,即在此过程中,产业结构变动受产业集聚发展与地区专业化水平变动的影响。产业的集聚化发展必然会带来生产要素的流动,从而形成地区生产的专业化,引起区域间产业结构的变化。而我国制造业集聚、地区专业化与结构差异度有什么趋势关系?我国区域间制造业结构是趋同或趋异?这些都值得我们研究。本文系统梳理了产业集聚、地区专业化和产业结构趋异方面的指标体系,试图对集聚指标进行改进,从行业和地区两个角度分析我国制造业集聚状况,同时研究我国地区专业化的空间分布和变动状况。运用协整检验分析我国制造业各省区间产业结构是否存在趋同,利用多维指标比较区域产业结构差异程度及变动特征。最后,深入挖掘空间集聚与结构趋异的趋势关系,探讨其背后的经济意义。本文以全国2000-2013年各省区的制造业分行业分地区就业人数作为研究对象,先从行业和地区这两个视角测度集聚状况,得出我国制造业行业集聚与区域集聚趋势并不相同的结论,行业集聚度上升而区域集聚度下降,即制造业走向扩散的过程中仍保持较高的行业集聚度。其次,研究发现,区域间制造业结构呈现趋异趋势,与以往结构趋同的结论不同。最后,基于多维指标比较分析三者之间的趋势关系,行业集聚与地区专业化、结构趋异之间表现为同向关系,即区域内行业集聚程度和专业化水平提升后,会引致区域间结构趋异;而区域集聚和地区专业化、产业结构趋异之间呈现反向趋势,说明我国制造业在逐步走向扩散的过程中并没有带来明显的产业同构现象,区域间制造业结构仍保持一定的差异度。本文对上述现象做出解释,并提出相应的政策建议,启示政府从资源优化配置入手制定产业政策,破除区域经济发展的壁垒,积极发挥市场的主导作用。