主体功能区战略是对我国社会发展从空间角度进行的科学与精准定位,传统的“唯GDP”发展理念和“一张试卷大家做”绩效评估方式已经不适应主体功能区战略的发展要求,故主体功能区视角下的政府绩效评估工作需要重新设计绩效评估指标体系。只有这样,从理论上,利于丰富政府绩效评估的基础研究,从实践上,利于把握现代政府绩效管理的核心问题,提高政府管理的绩效化、科学化。本研究共分为绪论、理论、问题现状、指标设计、实证研究和对策建议等六个章节。首先,本文对主体功能区视角下政府绩效评估的背景、方法和路线、框架和内容、创新及意义进行阐述。其次,对主体功能区视角下政府绩效评估的相关概念、国内外文献、典型理论和实践经验进行梳理和总结。再次,从政府绩效评估的理念、政府绩效评估的主体、政府绩效评估的保障、政府绩效评估的指标四个方面对重庆区县政府绩效评估现状、存在的问题及其原因进行研究。继次,对主体功能区视角下政府绩效评估的原则、评估的程序、评估的指标与方法进行研究。第五,利用设计的指标体系从主体功能区绩效、主体功能区绩效和传统绩效对比分析两个层面进行实证研究。基于主体功能区绩效、主体功能区绩效和传统绩效对比分析两个层面的实证结论:都市功能核心区和都市功能拓展区的“两绩效”发展差距较小,处于安全区域;城市发展新区、渝东北生态涵养发展区、渝东南生态保护发展区的“两绩效”发展差距较大,处于修正区域等结论,并提出优化重庆区县政府绩效评估和提升重庆区县政府绩效发展的两方面对策建议,以期对重庆五大功能区战略的更好实施提供政策依据,为重庆的发展提供活力与动力。