布氏锥虫类泛素蛋白TbUfm1的结构与功能研究

来源 :中国科学技术大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:long_teng
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
蛋白质的类泛素修饰作为一种重要的翻译后修饰方式,参与细胞内广泛的生物学进程,对细胞内复杂而有序的生命活动进行调控。类泛素家族蛋白的氨基酸序列同源性较低,但其三维空间结构则却非常保守。类泛素蛋白修饰途径与泛素蛋白修饰途径类似,都是通过三步酶促反应将其自身共价连接到底物上,从而影响底物的功能。作为一类类泛素修饰蛋白,Ufm1(ubiquitin-fold modifier1)在除酵母以外的真核生物中十分保守,目前经研究证实的Ufm1及其修饰的主要功能是维持内质网内环境稳定,参与调节内质网压力应激。此外,在生理上,Ufm1系统还在胚胎发育、血细胞分化和肿瘤发生等进程中起着重要作用,但这些功能的具体机制仍有待探究。布氏锥虫是导致非洲锥虫病的病原体,也是研究单细胞真核生物生命活动的模式生物。布氏锥虫中Ufm1蛋白的结构及生物学功能仍不清楚。在本研究中,对布氏锥虫Ufm1蛋白的结构及其细胞功能开展了研究,以此为揭示Ufm1系统的功能提供一些新的方向。
  通过序列比对,找到了布氏锥虫中类泛素蛋白Ufm1的同源蛋白TbUfm1。通过对原位表达TbUfm1蛋白的细胞系的亲和纯化及质谱分析,共鉴定到约100种TbUfm1底物蛋白及相关蛋白。这些蛋白中,发现了布氏锥虫中Ufm1的E1酶、E2酶及E3酶的同源蛋白TbUba5、TbUfc1和TbUfl1。另外,通过序列分析也找到了Ufm1特异性剪切酶2的同源蛋白TbUfsp2。利用体外酶促修饰反应,证明了这四个蛋白分别是布氏锥虫TbUfm1修饰系统的E1、E2、E3和特异性剪切酶,且TbUba5第271位与TbUfc1第115位的半胱氨酸是催化活性中心,对体外酶促修饰反应的顺利进行必不可少。
  同时,解析了TbUfm1的核磁溶液结构。TbUfm1由三个α螺旋和四个β片层组成,其中心螺旋α1与四个β片层构成了类泛素蛋白的典型折叠。与人的Ufm1结构相比,TbUfm1有着更长的N端延伸,更短的β3片层和一个额外的超短螺旋α2。进行了TbUba5、TbUfc1和TbUfl1分别滴定TbUfm1的核磁化学位移微扰实验,发现TbUfm1能通过其α1α2β1β2构成的疏水界面在体外与TbUba5结合,人的Ufm1与Uba5结合界面与此类似,两者之间存在许多保守的结合位点。
  进一步地,对布氏锥虫TbUfm1蛋白及其修饰系统的细胞功能进行了探究。在TbUfm1底物蛋白及相关蛋白中,细胞骨架蛋白占四分之一,通过细胞骨架抽提,发现TbUfm1、TbUba5、TbUfc1和TbUfl1在细胞骨架上均有分布,说明TbUfm1及其修饰系统可能参与了骨架相关的细胞活动。在TbUfm1底物蛋白及相关蛋白中,还存在一个保守底物TbUfbp1(Ufbp1的同源物)和一个锥虫属特有底物TbCAP80。TbUfbp1能在体外被TbUfm1修饰,其人的同源蛋白Ufbp1对维持内质网稳态起着重要作用,这暗示TbUfm1及其修饰可能也具有类似的功能。TbCAP80是一个多功能蛋白,为细胞生长所必需,敲除TbUfm1和TbCAP80均减弱了细胞对葡聚糖的内吞作用,证明了TbUfm1在囊泡运输方面的功能。除此之外,还发现TbUfm1与TbCAP80均定位于布氏锥虫糖酵解酶体上,这暗示了TbUfm1与细胞糖酵解相关。为了证明这个推断,检测了TbUfm1的敲除前后的细胞能量代谢物,发现TbUfm1的敲除会导致NADH和延胡索酸盐产量下降。另外,饥饿刺激会使TbUfm1修饰水平迅速上调,其中TbUfm1修饰的E2酶含量上升明显。这些结果说明TbUfm1参与到布氏锥虫能量代谢与饥饿应激的细胞活动中。在人的293细胞中,Ufm1在饥饿条件下能发生细胞定位的变化,与糖酵解酶体的标志物果糖-二磷酸醛缩酶共定位,暗示TbUfm1参与细胞饥饿应激这一功能可能在布氏锥虫和人细胞中是保守的。总之,不仅证明了布氏锥虫TbUfm1蛋白及其修饰在维持内质网稳定,调控囊泡运输方面的保守功能,并且揭示了其在糖酵解、能量代谢以及细胞饥饿应激方面的新功能。
其他文献
中华民族年代渺远,历史悠久,绘画之事发明既早,蕃衍纷歧。在原始绘画的艺术创造中,鳞介作为绘画符号就已经出现在人类的生活中了,之后鳞介中的龙鱼还作为一门画科在宋代的《宣和画谱》中进行了叙述,画谱中按时代的先后记述了五代及宋朝善于绘制龙鱼的画家传记与作品,这个时代也不乏出色的院体风格鳞介作品。随后,元明两代花鸟画中挥洒淋漓的水墨之戏更为流行,鳞介绘画中的文人意趣之韵更甚,到清代,域外艺术品大量涌入,艺
学位
李巍是中国当代著名花鸟画家,曾任吉林艺术学院教授,鲁迅美术学院客座教授。1934年出生于黑龙江克山县,1957年毕业于东北美术专科学校(今鲁迅美术学院)。在校期间专攻油画,练就了扎实的油画功底,毕业后在甘肃工作期间得到齐白石嫡传门人韩不言的悉心教导,继承了齐派“似与不似”的传统文人花鸟画精髓。在回到吉林省工作后结合东北独有的自然条件人文特性建立起了具有鲜明个人风格的写意花鸟风格体系。经过多年的潜心
学位
王冕的墨梅画上承宋以来文人墨梅画的传统,下启明清时期繁花密蕊式墨梅画的新风,其开创性的风格对元代以后中国墨梅画具有深远的影响。  本文第一章主要对王冕艺术风格进行探索、溯源和梳理。在南宋时期墨梅名家扬无咎及其传派的绘画风格基础上,王冕墨梅画的构图更加复杂,笔法更加迅捷、简省,形成疏、密两种典型风格。  本文第二章对王冕同时期风格相似的墨梅画家(如吴太素)和王冕传派(如陈录、王谦等)的墨梅画风格进行
学位
糖皮质激素类药物在临床上具有广泛应用,但长期使用会引起糖尿病、高血压、脂肪肝和向心性肥胖等多种副作用,进而影响其在临床中的应用。已有报道表明,糖皮质激素能够促进肝脏糖异生基因的表达,并且抑制脂肪UCP1的表达。糖皮质激素引起肝脏糖异生和抑制UCP1的表达机制尚不明确。我们的前期研究发现糖皮质激素能明显促进肝脏和巨噬细胞Klf9(Krüppel-likefactor9)的mRNA和蛋白水平。为了探究
研究背景:  创伤性脑损伤(Traumatic Brain Injury,TBI)是45岁以下,年轻个体死亡和残疾的主要原因,幸存的患者可能出现认知和记忆缺陷,视力和听力的丧失,运动功能障碍以及各种心理问题。TBI还是慢性神经退行性病变(如阿尔兹海默病,帕金森病等)的已知风险因素。然而迄今为止,在临床上TBI仍缺乏有效的治疗措施。间充质干细胞(Mesenchymal Stem Cells,MSCs
学位
肝癌为起始于肝细胞病变的癌症,肝癌有多种类型,肝细胞癌(HCC)是其最主要的类型。肝癌在世界范围内频繁发生,为全球第五大最常见的人类恶性肿瘤。国际上肝癌每年新发病例约63万,发病率和死亡率呈上升趋势,在中国情况最为严重。尽管手术切除合并放疗、化疗和生物治疗应用于肝癌的治疗,但是由于肝癌的复发和进展,肝癌患者的死亡率仍高达20-30%。HCC病变是一个复杂的多步骤的过程,伴随有ECM(细胞外基质)侵
学位
在细胞命运决定以及再生医学的研究中,诱导多能干细胞技术具有重要的价值,深入理解多能性调控网络以及在此基础上建立高效快速获得高质量的诱导多能干细胞(iPSCs)的方法是iPS技术走向应用的关键。目前关于体细胞重编程的研究主要集中在Yamanaka因子(Oct4/Sox2/Klf4/c-Myc,OSKM)诱导重编程体系,非Yamanaka因子诱导重编程也有报道,但重编程的效率极低,阻碍了相关机理的研究
本文主要针对真核生物转录延伸因子TFIIS与RNA聚合酶相关因子1复合物(Paf1C)的Leo1亚基的相互作用的结构研究和布氏锥虫中乙酰转移酶TbEsa1的Tudor结构域的结构与功能的研究来开展。  1.转录调控在真核生物中是十分复杂的。很多的蛋白复合物都会参与到转录起始,延伸和终止的过程。Paf1C复合物就是其中之一,能够调控基因的表达。在Paf1C复合物的调控过程中,转录延伸因子(TFIIS
鼠源的caspase-11是一类炎症性的caspase蛋白,其作为非经典的炎症小体的重要组成成分在机体应对胞内脂多糖(lipopolysaccharide,LPS)的侵染中起重要作用。脂多糖(LPS)作为革兰氏阴性菌细胞壁成分是激起机体免疫反应的重要成分。在生理状态下,革兰氏阴性菌会产生包裹有LPS的外膜囊泡(outer membrane vesicle,OMV),通过宿主细胞的胞吞作用进入细胞质
学位