论文选择了科技自主创新能力领域的一个题目做为研究对象。加强科技自主创新能力建设是目前克服全球经济危机、保持我国持续发展的关键手段。但是,当前对科技自主创新的认识还不深入,科技自主创新能力评价的理论基础相对薄弱,在评价指标的设计中也存在较大的随意性,缺乏足够的说服力。因此,论文选择了该领域中关于科技自主创新能力的评价作为研究内容,目的是引进和吸收国外成熟的方法论体系的同时,大胆尝试新的方法,将量子搏弈论方法引入科技自主创新能力评价体系。本论文属于应用基础性研究成果,论文以科技自主创新能力为切入点,对科技自主创新在我国社会发展中的影响及中科院研究所在我国科技进步中的作用进行了详细分析。在探讨中科院研究所自主创新特性的基础上,对中科院研究所科技自主创新的定义,特点,相关的评价体系及研究现状进行了研究,建立以量子博弈理论为核心的评价模型。根据指标体系的设置原则,分析了科技自主创新能力评价的量子博弈基本要素及相应关系,目标旨在科学构建基于量子博弈理论的中科院研究所科技自主创新能力的评价指标体系,提出了“科技自主创新能力与量子博弈能力的等同性原则”的理论观点,并通过计算量子纠缠度计算科技自主创新能力。在理论分析与实证分析过程中,利用主成分分析法和权重法与量子博弈方法对中国科学院相关研究所的数据进行了比较分析,主成分分析法充分反映被研究对象个体之间的差异,中物院权重法建立了科学规范的科研考核评价体系,这两种方法可以实际地分析科研院所科技自主创新能力,量子博弈模型与之分析比较,能较好的说明其引入评价领域的设想是完全可行的,在多对象领域、无标准评价、注重评价对象相互之间的影响等方面有着其独特的优势,极大的丰富了评价的方法与理论。论文的基本思路是全面分析科技自主创新的特点；明确了竞争与合作在科技自主创新中所起的巨大作用；认真讨论了已有的评价科技自主创新能力的方法,仔细分析了各自的优缺点。在此基础上,选用了以竞争与合作为主要研究对象的量子博弈理论及其方法对科技自主创新能力进行评价,在理论上采用量子博弈论中的鹰鸽模型进行分析,讨论了量子博弈与科技自主创新能力各因素的对应关系,提出了用纠缠度数值表征科技自主创新能力的方法。在此理论的指导下,明确了相应的指标因素,建立了一套相对完整的科技自主创新能力评价体系,最后以中国科学院的部分研究所为实证的评价对象,初步评价了相关研究所的科技自主创新能力,并与其他评价方法进行了比对分析。