以蔬菜花卉废物为主体的农业固体废物是滇池流域的主要面源污染形式之一，采用现代好氧堆肥技术把这些废物转化为有机肥料对于控制滇池流域的面源污染、修复因长期大量施用化肥所造成的对土壤结构破坏、实现农业可持续发展意义重大，而蔬菜废物的高水分特性和高产生量及其与花卉废物的不协同降解使得常规堆肥工艺难以得到有效应用。本论文对蔬菜花卉废物和粪便共堆肥进行了系统的物料配比筛选和工艺优化中试规模实验研究，首次提出了“序批式进料+分阶段温度反馈通风控制”堆肥新工艺，建立了双底物堆肥数学模型并进行了数值模拟，并成功实现了工厂化试运行。 中试规模实验的蔬菜花卉废物和粪便共堆肥的物料配比筛选实验表明，初始物料含水率是制约蔬菜、花卉废物和粪便共堆肥能否成功的关键，首先控制混合物料的初始含水率在70％左右，据此反算蔬菜和花卉废物的配比，可以实现共堆肥。蔬菜花卉废物共堆肥的工艺优化实验表明：分阶段温度反馈通风控制能较好的在堆肥过程中兼顾杀灭致病菌、降解底物和去除水分的要求；“序批式进料+分阶段温度反馈通风控制”工艺能提高蔬菜废物处理能力1.5倍，较好解决了物料的高水分和降解不协同难题。氨挥发是堆肥中氮损失的主要途径，pH值升高是氨挥发的主要原因，在物料中加入过磷酸钙共堆肥能降低堆体pH值，提高堆体氨氮含量，减少氨气的挥发，控制一定的氮素损失。建立了双底物堆肥反应动力学模型并进行了不同进料方式和不同通风方式的堆肥数值模拟，以模拟和中试结果为依据，设计建造了处理规模为30t/d的堆肥示范工厂，并成功实现了试运行。对示范工程采用成本收益法进行的经济评价表明，即使不计入间接收益，示范工程亦能获得良好的经济效益。