高通量测序技术的迅猛发展,产生了大量的基因组数据。如何利用这些数据挖掘出有价值的生物学知识,已成为大数据时代生物信息学研究中新的机会与挑战。细菌作为微生物种群中非常重要的组成,与人类生活息息相关。对细菌基因组的研究,能够使其在医药、环保、生物技术等领域更好的发挥作用。在DNA复制过程中,前导链和后随链具有不同的复制机制。已有研究表明,大多数细菌基因组的前导链和后随链上广泛地存在着核苷酸组成、基因方向等偏差特征。在本文中,我们首先计算了核苷酸组成偏差与基因方向偏差之间的相关性,旨在从单基因组角度定量分析物种的链偏差规律。通过计算发现GC和RY偏差与基因方向偏差之间的相关性较高,在本研究涉及的约60%的基因组中,其相关系数均大于0.9。这些结果表明,在细菌基因组中核苷酸组成偏差与基因方向偏差存在相互关联机制。此外,为了对细菌基因组的各类链偏差进行定量评估,我们发展了一种基于V字形模型的拟合算法,并把R~2作为评价拟合优劣的特征参数。一般而言,核苷酸组成偏差和基因方向偏差均可以用于预测细菌基因组的复制起始点。其中,最为常用的是GC偏差,但对于某些细菌,其GC偏差并不明显,我们可以使用其它R~2值较大的偏差曲线来完成预测,比如AT偏差,基因方向偏差等。