基于单细胞转录组测序数据深入挖掘脑胶质瘤细胞间相互作用

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脑胶质瘤是最常见的成人恶性脑癌,其以较差的临床预后与高度的分子异质性而著称。传统的研究是基于多细胞的转录测序技术,其只能获得细胞群体的平均特征,而忽略了肿瘤组织内部细胞之间的异质性。本文系统地研究了6341个来自脑胶质瘤的细胞的单细胞转录组数据,并通过数据降维等方法鉴定出了其中的癌细胞与浸润在免疫微环境的健康细胞。通过单细胞转录组数据和TCGA转录组数据结合分析不同类型细胞的配受体表达情况,鉴定出16对显著相关的癌细胞自分泌配受体信号分子。本文进一步分析发现了癌症干细胞与浸润的免疫细胞间的细胞间相互作用,并鉴定出66个配受体对,其中部分信号分子会显著影响脑胶质瘤患者的预后。之后,我们根据这66个配受体对的表达特征建立基于XGBoost算法的脑胶质瘤预后风险预测模型,可以通过这66个配受体对的表达情况精准预测出脑胶质瘤患者的预后风险。模型在独立验证集中也取得了良好的表现。总之,本文的研究不仅揭示了脑胶质瘤内细胞间重要的功能相互作用,而且为脑胶质瘤患者的预后提供了潜在的标志物。
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