细菌ACC脱氨酶基因表达载体的构建及转化和草螺菌泛基因组学及ACC脱氨酶基因的分析

来源 :浙江大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:ying33809
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
1-氨基环丙烷-1-羧酸(ACC)是植物合成乙烯的直接前体。ACC脱氨酶催化分解ACC生成α-酮丁酸和氨。有ACC脱氨酶的微生物能分解植物产生的ACC,降低植物在逆境下产生胁迫乙烯的水平,从而缓解植物在逆境下遭受的生长抑制,减轻病原菌导致的病症。本研究克隆了7个细菌的ACC脱氨酶结构基因(acdS),构建了acdS的原核表达载体,对草螺菌属(Herbaspirillum)细菌的泛基因组和ACC脱氨酶基因进行了分析。本研究从ACC脱氨酶活性不同的伯克氏菌属(Burkholderia)、(?)单胞菌属(Pseudomonas)、草螺菌属和中慢生根瘤菌属(Mesorhizobium)细菌中克隆了acdS,构建了7个acdS表达载体pBBRacdS并转化农杆菌C58Cl。(?)得的农杆菌工程菌中,acdS来源于Burkholderia和Herbaspirillum的工程菌表现出ACC脱氨酶活性,且活性高低与相应来源菌株的活性有一定相关性;而acdS来源于Mesorhizobium和Pseudomonas的工程菌没有ACC脱氨酶活性,可能是农杆菌中不具备来源菌株中acdS的表达调控机制。本研究通过高通量测序获得了5个致病Herbaspirillum菌株Os34、Os38、Os44. Os45和Os49的基因组草图序列,与促植物生长菌株H. seropedicae SmRl的基因组相比有一定差异。用GGDC(Genome-to-Genome Distance Calculator)分析发现这5个Os菌株不属于H. seropedicae种。用PGAP (Pan-Genomes Analysis Pipeline)对5个Os菌株和Herbasp irilum属的SmR1、GW103、CF444、YR522、P6-12的基因组进行泛基因组学分析发现Herbaspirillum属菌株具有开放型的泛基因组;随着基因组数目的增加,核心基因数目趋于稳定。ACC脱氨酶基因是Herbaspirillum属细菌的核心基因。对Hlerbaspirillum属菌株ACC脱氨酶氨基酸序列的系统发育分析显示5个Os菌株、SmRl、GW103和YR522菌株的ACC脱氨酶氨基酸序列的系统发育地位与它们的分类地位不符,与其他细菌ACC脱氨酶的亲缘关系很远;用Sigi-HMM和IVOM预测没有发现5个Os菌株和SmR1的ACC脱氨酶基因簇在基因组岛内,不支持它们的ACC脱氨酶基因是通过水平转移获得的,有可能是ACC脱氨酶同源蛋白的基因在进化中发生突变而导致编码特殊的ACC脱氨酶。本研究构建的组成型表达acdS的农杆菌工程菌可能通过降低植物产生乙烯的水平而减弱植物的防卫反应,增强侵染植物的能力,延缓外植体衰老,提高农杆菌介导的植物转化效率。acdS表达载体pBBRacdS还可以导入到其他植物促生细菌,用于帮助植物抗逆,也可以导入到根瘤菌中,提高根瘤菌的结瘤能力研究发现5个Herbaspirillum Os菌株的ACC脱氨酶表现出不同寻常的特性,值得进一步研究它们的结构和功能及表达调控机制。这些Herbaspirillum致病Os菌株可能属于一个新种,进一步的比较基因组学分析将找到它们和不致病菌株SmR1在基因组上的差异,在基因组水平揭示Os菌株致病和SmR1不致病的遗传机制。
其他文献
根据选定的升降桅杆整体结构形式和碳管的铺层方案,通过有限元计算,对18 m CFRP升降桅杆进行了抗风模拟分析。模拟计算结果显示,对碳纤管组装成的18 m CFRP升降桅杆,在28 m/s
环状化合物的碳-碳键构建与断裂反应研究是有机化学领域备受关注的前沿课题之一。尽管具有高张力的四元环化合物应用于过渡金属催化的碳-碳键断裂开环反应研究已取得了令人瞩
本文首先通过接枝改性制备了热塑性淀粉接枝共聚物,再将其与聚乳酸共混,制备性能优异的聚乳酸共混物。将蒙脱土与淀粉接枝共聚物乳液复合、共沉淀制备了复合淀粉接枝共聚物,
长期以来,我国的中学教育重视书本知识的传授,忽视科学能力的培养。学生的学习兴趣得不到有效培养,学习热情不能有效激发。作为教师,应当改变传统的那种一讲到底,填鸭式的教
西部资源型城市的转型发展是中国现阶段建设资源节约型和环境友好型社会,实施可持续发展的一个重大课题。文章论述了西部资源型城市面临的资源、生态环境和自我发展能力等三方
在互联网金融高速发展的背景下,银行如何构建科学合理的网点布局是十分重要的。文章利用ArcGIS对昆山的商业圈、行政圈、公共服务设施以及景点进行了缓冲区分析和叠置分析。
背景:脑卒中患者大脑运动中枢受损,调控呼吸运动的输出信号减弱,从而影响患者呼吸功能。膈肌是最主要的呼吸肌,它提供60%左右的吸气动力,咳嗽前膈肌的有效收缩提供足够的吸气量。膈肌运动不足导致潮气量降低,抑制充分的咳嗽,增加吸入性肺炎发生的风险。体外膈肌起搏器(external diaphragm pacer,EDP)通过体表定位点刺激膈神经,诱导膈肌收缩,有研究表明EDP能提高慢性阻塞性肺疾病患者的
微生物是水生态系统的重要组成部分,广泛分布在各种天然水体中。泥沙在水生态系统中为微生物聚集提供了良好的基底条件。微生物代谢产物分泌胞外聚合物,在泥沙表面形成生物膜
<正> 少时就喜欢画画,但只是兴趣所至随意涂抹,到上初中参加了课余美术组学习,才得到正规素描、色彩训练,我们的美术老师兰尚廉是内蒙古师大的高材生,水彩画画得非常好,一幅