2003年，广东省委、省政府出台了《中共广东省委、广东省人民政府关于加快民营经济发展的决定》，决定连续5年对本省中小企业的某些技术创新和技术改造项目进行财政扶持。本文作者也有幸参与了扶持工作的效果评估工作。在项目实践中，项目组成员察觉到政府扶持工作中存在的种种委托代理问题，由于信息的不对称，使得政府在扶持过程中始终处于弱势地位。这样不利于政府扶持工作的开展，也不利于中小企业的利益。 本文从问卷调查研究开始，在调研的实践中定性的提出政府扶持中小企业中遇到的委托代理问题：在政府选择扶持对象时出现的是逆向选择问题；在扶持过程中出现的是道德风险问题。本文借鉴前人总结的委托代理模型、博弈论和实物期权理论等对政府扶持项目过程中出现的问题做理论研究。然后借鉴一些学者解决委托代理问题的方法，来探讨在政府扶持中小企业项目过程中委托代理问题的解决方法。 本文首先对我国政府扶持中小企业的状况作了介绍，确定了在扶持工作中政府与企业间的委托代理关系。然后介绍了委托代理问题的三个理论基础：委托代理理论、信息不对称理论和契约理论。这些理论基础的介绍对论文核心部分的研究有铺垫作用。本文核心部分是研究政府与企业间委托代理问题的两个具体方面：一个是逆向选择问题，另一个是道德风险问题。通过建立数理模型探讨逆向选择问题的产生，并提出了解决方式。通过运用博弈论探讨了道德风险的产生原因，并运用多重博弈和实物期权理论提供了解决道德风险问题的建议。论文最后还在我国法制和市场环境建设上做了一定补充。从法制建设、信息市场的完善和政府的财政扶持机制三方面做了介绍和建议。