肝内胆管细胞癌差异LncRNA表达分析

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【目的】:肝内胆管细胞癌的发病率逐年上升且起病隐匿、易转移、并对化疗不敏感,具有不良的临床后果。目前尚未有效的早期诊断标志物、治疗方法、预后判断标准。本实验期望能够通过对肝内胆管细胞癌肿瘤组织中差异长链非编码RNA进行分析,讨论长链非编码RNA在肝内胆管细胞癌的发病中所可能起到的作用,并筛选出与ICC发病、治疗或预后相关的Lnc RNA。【方法】:收集经临床病理证实为肝内胆管细胞癌的肿瘤组织与正常胆管组织,利用Angilent 4*180K人类Lnc RNA芯片检测其m RNA与Lnc RNA的表达情况,并筛选出具有差异表达的m RNA与Lnc RNA。通过m RNA共表达分析预测差异Lnc RNA可能的功能,并从中筛选出于具有肿瘤相关性的Lnc RNA,以便行进一步研究。【结果】:通过对芯片数据进行分析,共发现差异表达的m RNA 718条,其中上调表达的m RNA有432条,下调表达的m RNA有286条;共发现差异表达的长链非编码RNA 1740条,其中上调表达的长链非编码RNA有1427条,下调表达的长链非编码RNA有313条。研究发现肿瘤相关性长链非编码RNA CRNDE、CBR3-AS1、SOX2-OT在肝内胆管细胞癌中具有差异表达,并根据Lnc RNA预测结果从中筛选出具有肿瘤相关性且表达差异倍数大于4倍、P值小于0.01的Lnc RNA 86个。【结论】:长链非编码RNA可能参与细胞功能的各个方面,在肝内胆管细胞癌的发病中起着重要作用,其可能通过调节细胞内信号通路而差异ICC致病过程。长链非编码RNA CRNDE、CBR3-AS1可能在ICC致病过程中具有关键作用。Mapk信号通路、Rap1信号通路、Ras信号通路、PI3K-AKT信号通路可能在ICC致病过程中起重要作用。
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