红柱四节蜉Baetis rutilocylindratus和紫金柔裳蜉Habrophlebiodes zijinensis线粒体基因组全序列的测定(昆虫纳:蜉蝣目)

来源 :南京师范大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kuaiyu001
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
蜉蝣是一类古老而原始的昆虫,其所具有的许多特征对重建有翅昆虫的起源及进化意义极大。然而,蜉蝣目在有翅昆虫内的系统发育地位却一直悬而未决,其目内高级分类单元之间的系统发育关系也有多种意见,已有的建立在形态及分子证据上的研究始终无法取得较一致结果。近年来,线粒体基因组全序列在昆虫纲系统发育关系重建中得了较多应用,但蜉蝣目内却鲜有报道。   本研究采用长距离聚合酶链式反应(Long PCR)和常规PCR扩增线粒体基因组,将PCR产物直接测序或克隆菌斑测序,对采自南京紫金山的红柱四节蜉Baetis rutilocylindratus和紫金柔裳蜉Habrophlebiodeszijinensis的线粒体基因组全序列进行了测定。红柱四节蜉线粒体基因组全长14883 bp,为闭合环形双链DNA分子,包括37条编码基因(13个PCGs、22个Trna基因和2个Rrna基因)。紫金柔裳蜉线粒体基因组共测得长度为14355 bp的序列,未能完全扩出部分srRNA和控制区及nad2,已测出部分包括34条编码基因(13个PCGs、19个Trna基因,1个lrRNA和部分srRNA)。   依据DNA序列重建和图示了两种蜉蝣线粒体基因组的基因排列顺序。结果表明,除紫.金柔裳蜉的trnA和trnR发生倒位外,两物种的线粒体基因组的基因结构、顺序、方向与原始六足动物的相同。这可能显示蜉蝣的线粒体基因组结构比较原始。trnA和trnR倒位可能是当双链DNA在两相邻座位处发生断裂后又发生了基因重组,即断裂片段与DNA重新连接后产生一个短的倒位片段。   我们在GenBank中下载了18种其它有翅昆虫和2种无翅昆虫的线粒体基因组全序列,并将后两种作为外群,利用线粒体基因组中的12个蛋白编码基因核苷酸序列及其编码的氨基酸序列对22种昆虫所构建的最大似然树(Maximum Likelihood tree,Mltree)和贝叶斯树(Beyesinference tree,BI tree)均显示蜉蝣目是蜻蜓目+新翅类的姐妹群。   上述产生的ML、BI树均显示蜉蝣目内五个物种之间的关系为(红柱四节蜉Baetisrutilocylindratus+紫金柔裳蜉Habrophlebiodeszijnensis)+(尤氏拟亚非蜉Parafronurusyoui+(东方蜉Ephemera orientails+大短丝蜉Siphlonurus immanis)),这似乎表明它们所代表的科之间的关系为:(四节蜉科Baetidae+细裳蜉科Leptophlebiidae)+(扁蜉科Heptageniidae+(蜉蝣科Ephemeridae+短丝蜉科Siphlonuridae))。这与使用起始和终止密码子的频率所得到的结果相同,即拥有更多共享密码子的类群会最易聚合成一支。这一结果的可靠性可能需要更多探讨,一是因为分类单元太少,二是因为似乎聚合程度与相似性相关而不是衍征,三是可能蜉蝣线粒体基因组保留有很多祖征。
其他文献
该文研究非贵金属/沸石型轻烃异构化催化剂,选择不同的沸石载体和非贵金属组分制备了一系列催化剂,研究了制备条件对催化剂性能的影响,采用TG/DTA、Py-IR、XRD等手段对催化剂
该文考察了操作条件中主要因素对催化裂化汽油烯烃含量的影响.结果表明:操作条件对催化裂化汽油烯烃含量有很大的影响.降低掺渣率、反应温度,增加剂油比、延长进油时间,催化裂
有机小分子的光化学、光化学生物学及其在生物分子的识别、标记、剪切及拆分方面的应用是研究的热点之一.该论文研究了取代1,8-萘酰亚胺和萘并吡喃酮与尿苷、取代均三嗪、二
十足目是甲壳动物亚门中最具有多样化的类群之一,随着十足类分子系统学的发展,这类动物的系统演化问题一直是学术界争论的焦点。十足目被划分为2个亚目(即枝鳃亚目和腹胚亚目
该实验室正在开发一种适合于边远地区,利用廉价中小型天然气资源的GTL技术.该技术采用天然气两段空气氧化制合成气和无尾气循环的费托合成工艺,通过两个串连固定床反应器和两
该论文工作是采用油酸、聚全氟醚羧酸和有机胺为主要原料合成稠油乳化降粘剂,并进行了复配研究和性能测试.还用量子化学方法进行了相关的理论研究.合成研究中制备出三个碳氢
"微时代"当道,进一步丰富了传统气象服务.本文以"东莞天气"在台风"天兔"和"尤特"影响期间的相关微博及评论数、转发数作为数据样本,并与"广东天气"、"深圳天气"进行比对,分析