生物量特征的提取在生物工程方面有重要的意义，生物量分析己涉及到生物工程很多领域：细菌，酵母，真菌，动植物细胞，原生物。本文的研究对象为生物发酵中的丝状菌，其形态分为两种类型，线状菌丝和菌丝球。主要工作是目标对象即线状菌丝，菌丝球，菌丝球核的提取，需要提取的参数是线状菌丝的长度和菌丝球、菌丝球核的面积。 从两个角度采用三种方法分析处理线状菌丝。一是从阈值分割的角度综合分析线状菌丝的提取，结合两种方法即：基于最大类间方差的自适应分割方法和二维最大熵法处理结果的优点，迭代求解出最后的分割结果，这一方法基本解决了菌丝的断裂问题。二是从阈值分割的角度结合小波变换提取目标，得到比较理想的结果。三是从边缘检测的角度提取线状菌丝，结合线状菌丝的单点宽的特点，综合运用Laplaciam素描和Sobel边界单点化两种方法得到的骨架，处理结果失真很小。 从两个角度分析了两种菌丝球核的分割问题： 一是常规的阈值分割方法得到菌丝球和菌丝球核，提出运用线段编码法标记二值图像的连通区域提取出面积参数。 二是对运用常规分割方法失效的特殊的菌丝球核图像运用模糊C均值聚类(FCM)算法分析图像提取面积参数，得到了比较理想的结果。