罕见常染色体显性遗传黄斑营养不良临床和分子遗传学研究

来源 :北京协和医学院中国医学科学院 北京协和医学院 中国医学科学院 清华大学医学部 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hensun01
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目的:对罕见常染色体显性黄斑营养不良的临床表现进行总结分析,研究其致病基因变异,并探讨表型与基因型的相关性。  方法:纳入了2011年-2017年8月于北京协和医院眼科就诊的6个常染色体显性遗传黄斑营养不良家系共12例患者。1.临床研究:了解患者病史及家族史,初步判断其遗传方式。记录眼科检查包括常规眼科检查(视力、眼压、屈光度、眼前节及眼底等),光学相干断层扫描(optical coherence tomography,OCT),眼底彩色照相,眼底自发荧光成像(fundus autofiuorescence,FAF),视野(visual field,VF),视网膜电图(electroretinogram,ERG)以及眼电图(Electrooculography,EOG)等辅助检查。2.分子遗传学研究:患者签署知情同意书后,抽取患者及家庭成员静脉血,提取其基因组DNA。对上述6个家系的共12例患者进行靶向捕获二代测序,对检测到的可疑致病变异通过Sanger测序进行家系共分离验证;对上述检测未发现致病变异的家系,选择先证者及患者进行全基因组测序(Whole genome sequencing,WGS);测序结果需一系列的生物信息学分析,判断变异的致病性。3.对初步确定的致病变性变异,分析表型及基因型的相关性。  结果:共纳入来自6个黄斑营养不良家系的12例患者,其中男性患者7例,女性患者5例,患者年龄介于4岁到62岁之间,中位年龄21岁。  1、临床表现:12例患者均拟诊为黄斑营养不良,最佳矫正视力(BCVA)介于0.07-1.2之间。其中眼底表现为范围大小不同的黄斑萎缩灶,部分患者在萎缩灶边缘或萎缩灶内可见色素沉着;自发荧光多表现为黄斑区的低荧光伴病灶周围点状、环状高荧光。OCT表现为黄斑区视网膜层次结构的不同程度的萎缩,EOG多表现为双眼Arden比下降,ERG检查无异常。  2、分子遗传学结果:经靶向捕获二代测序检测发现SRF_732家系先证者SRF_732携带有两个基因上的错义变异,分别为EFEMP1(NM_001039348)基因:c.1033C>T(p.Arg345Trp)和C1QTNF5(NM_015645)基因:c.707G>A(p.Trp236Ter);患者SRF_476发现SNRNP200(NM_014014)基因上的变异,c.1118G>A(p.Arg373Gln)。经家系共分离后,发现SRF_732家系中先证者SRF_732、SRF_857、SRF_1155(表型正常)均发现有EFEMP1(NM_001039348):c.1033C>T(p.Arg345Trp)变异,SRF_1154和正常对照没发现该变异;SRF_732、SRF_857、SRF_1155和SRF_1154(表型正常)均发现有C1QTNFS(NM_015645):c.707G>A(p.Trp236Ter)变异,但家系成员SRF_1154和SRF1155表型正常。经全基因组测序发现SRF22家系的三名患者(SRF22、SRF_23和SRF_24)携带有6号染色体上的串联重复变异(chr6:100033285-100067462),该变异位于与北卡莱罗纳黄斑营养不良(north carolina macular dystrophy,NCMD)相关的MCDR1区域,和已报道的MCDR1区域发现的串联重复变异区域有重叠。SRF_22家系眼底表现和NCMD的眼底表现很相似。  结论:常染色体显性遗传黄斑营养不良具有很强的临床及遗传异质性,不同家系患者或者同一家系的不同患者在发病年龄、表型严重程度等方面有明显的差异,这些都增加了临床诊断的难度。包括靶向捕获测序、全基因组测序在内的二代测序技术是分子诊断的有效方法。本研究最后确定SRF_732家系为Malattialeventinese黄斑营养不良,其致病基因为EFEMP1。SRF22家系的所有患者都有6号染色体上的串联重复变异,SRF22家系的诊断为北卡莱罗纳黄斑营养不良(north Carolina macular dystrophy,NCMD),这是首次确诊的中国NCMD家系。
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