应用SELDI-TOF-MS筛选口腔鳞癌血清生物标志物及建立人工神经网络诊断模型的研究

来源 :泸州医学院 西南医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jack332904910
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目的:口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)是一类严重危害人类健康的疾病,直接影响到患者的进食、发音和美观。据统计OSCC约占口腔黏膜原发性恶性肿瘤的97%,占头颈部恶性肿瘤的40%左右,对其癌前病变和早期恶变的识别和治疗是OSCC早期诊断和预防的重要措施。我们利用SELDI技术对口腔鳞癌患者和正常对照的血清蛋白质进行检测,通过Biomarker Wizard3.1系统软件对蛋白质丰度和质荷比(M/S)进行分析,期望筛选出可用于临床口腔鳞癌早期诊断和病情监测的特异性血清生物标记,并进一步对口腔鳞癌患者和正常对照之间有显著差异的血清蛋白质峰进行优选,建立数据库,结合人工神经网络(ANN)建立诊断模型,从而突破传统的应用组织活检才能确诊口腔鳞癌的技术“瓶颈”。 方法:收集入院前未接受放、化疗的口腔鳞状细胞癌患者血清35例,其中男性21人,女性14人,年龄33-68岁,中位年龄51岁。患者均无其他恶性肿瘤或严重内科疾病,抽血前均未行放、化疗。发生部位:颊部5例,舌缘、舌腹及舌根部9例,牙龈7例,口底11例,咽旁3例,耳廓2例,其中伴颈部淋巴结转移4例,术后诊断为鳞状细胞癌,按WHO口腔鳞状细胞癌组织分型标准分高分化、中分化、低分化3级,其中高分化(鳞癌Ⅰ级)32例,中-低分化(鳞癌Ⅱ-Ⅲ级)3例;根据抗癌联盟(UICC)TNM临床分期为T1、T2期20例,T3、T4期15例,患者均无患癌家族史。以口腔粘膜溃疡病人(病检确诊为非癌性病变)为正常对照,共22例,其中男性15人,女性7人,年龄范围25-60岁,中位年龄50岁。运用表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI-TOF-MS)技术检测35例口腔鳞癌,22例正常对照,用AU芯片获取血清蛋白表达指纹图谱,并用Biomarker Wizard3.1软件对检测数据进行分析,得到的数据进行初步的统计学分(计算均值X、P值和标准差S),P<0.05被认为差异具有统计学意义。从口腔鳞癌和正常对照血清蛋白质指纹图谱的具有显著性差异的质荷比中,优选出9个蛋白质,应用BP人工神经网络建立口腔鳞癌神经网络诊断模型。 结果:1.口腔鳞癌患者与正常人的血清间筛选出103个差异蛋白(p<0.05),其中9个蛋白有显著性差异(p<0.001),有6个蛋白质峰在口腔鳞癌血清中高表达,3个蛋白质峰低表达,它们的M/Z分别为2775、3543、5906、5927、5948、5970、5990、6430、6626。2.人工神经网络模型诊断口腔鳞癌的灵敏度为90%,特异度为89.2%,阳性预测值为81.8%,阴性预测值94.3%(诊断准确度为89.5%)。 结论:1.口腔鳞癌和正常对照血清蛋白质组学水平有显著性差异。2.M/Z为2775、3543、5906、5927、5948、5970、5990、6430、6626的蛋白质可能是筛选口腔鳞癌和正常人的差异蛋白,可能是口腔鳞癌的血清生物标志物。3.SELDI-TOF-MS技术可能是寻找口腔鳞癌血清生物标志物的有效工具。
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