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目的:了解重庆地区乙型肝炎病毒（HBV）基因型的分布情况并进行精确定量分析,并探讨HBV基因型及前C区突变与慢性乙型肝炎病情的关系。方法:采用荧光分型定量PCR（GQ-PCR）法对152份血清标本进行HBV基因分型并定量,分析基因型在各肝病组的比例;巢式PCR扩增前C区,测序分析前C区nt1896位点。结果:152株血清标本成功分型148株（97.37%）,其中B基因型109例（男88例,女21例）(定量值范围:412 log10copies/ml,均值和标准差:7.94±1.44log10copies/ml),C基因型10例（男6例,女4例）（定量值范围: 510 log10copies/ml ,均值和标准差: 8.12±1.64 log10copies/ml）,基因B+C混合型29例（男24例,女5例）（定量值范围:410 log）10copies/ml,均值和标准差:7.45±1.59 log10copies/ml)。检出率分别为73.65%（男74.58%,女70.00%）、6.76%（男5.08%,女13.30%）、19.59%（男20.34%,女16.70%）。B基因型在肝硬化组、肝癌组、慢性乙型重型肝炎组和慢性乙型肝炎（轻-中度）组的比例分别为38.53%、12.84%、33.03%和15.60%;C型在肝硬化组、肝癌组、慢性乙型重型肝炎组和慢性乙型肝炎（轻-中度）组的比例分别为70.00%、10.00%、20.00%和0;B+C混合型在在肝硬化组、肝癌组、慢性乙型重型肝炎组和慢性乙型肝炎（轻-中度）组的比例分别为62.07%、6.90%、20.69%和10.34%。B+C混合型在肝硬化中比例显著高于B型（χ2=5.16,P<0.05）。B、C型及B+C混合型在肝癌组、慢性乙型重型肝炎组和慢性乙型肝炎（轻-中度）组的分布无统计学意义。随机检测50例血清标本,其中10例出现了G1896A位点的变异,这10例中4例为B型,6例为B+C混合型,两者突变率比较:B+C混合型较B型高（χ2=4.51,P<0.05）。结论:重庆地区HBV优势基因型以B型和B+C混合型为主,与前几年相比较,C型有下降趋势。基因型的分布与性别无关（P>0.05）。HBV载量在B、C型及混合型三者之间无统计学差异（P>0.05）。B+C混合型较B型更容易引起肝硬化（P<0.05）,但基因型似乎与慢性乙型重型肝炎没有关联（P>0.05）,由于C基因型样本偏少,有待扩大样本进一步论证。B+C混合型有比B型更高的突变率。荧光分型定量PCR（GQ-PCR）法灵敏度和特异性均高于传统的直接测序分型法,能够同时准确的对临床标本进行HBV基因分型及定量检测,有望替代传统的基因分型方法。