抗苗勒氏管激素（anti-müllerian hormone, AMH）是一种糖蛋白激素，属于β-转化生长因子（TGF-β）超家族。Amh基因能够在雄性哺乳动物性腺分化期，抑制缪勒氏管的形成，从而抑制雌性生殖器官的发育。它作为一个重要的性别分化因子，能够调节生殖细胞的发育及分化。抗苗勒氏管激素二型受体（anti-müllerian hormone type II receptor, AMHRII）也是转化生长因子β受体超家族的成员，它与配体AMH结合后，通过细胞内的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶催化结构域起作用。为了研究 amh和 amhrII基因在红鳍东方鲀各组织和不同发育时期的表达情况，进而研究 amh和 amhrII基因在红鳍东方鲀性别分化和性腺发育等过程中的作用。本实验利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）技术分析amh和amhrII基因在红鳍东方鲀成鱼的肾脏、脑、心脏、脾脏、肝脏、精巢和卵巢等不同组织，以及23、30、40、60、80日龄及2龄和3龄，7个发育时期个体水平上的表达情况。　　本研究主要内容包括：⑴红鳍东方鲀amh基因在脾脏中的表达量最高，其次是肾脏、肝脏和精巢，在卵巢和脑中的表达量较低，并且精巢中的表达量大约是卵巢中的2倍；23日龄、30日龄、2龄和3龄雄鱼 amh基因的表达量极显著高于同时期的雌鱼的表达量（P<0.01），在60日龄和80日龄时雌鱼表达量高于雄鱼，40日龄雌雄鱼的表达量无显著性差异；在雄性红鳍东方鲀不同发育时期中，23日龄到30日龄amh基因的表达量升高到最大值，到2龄期间呈现降低的趋势并到达最低值，再往后又有所回升。雌鱼整体呈现先增长后降低的趋势，80日龄时amh基因表达量最高。从以上数据可以推断，amh基因在红鳍东方鲀卵巢分化过程中发挥着一定的作用。⑵红鳍东方鲀amhrII在卵巢中的表达量最高，大约是精巢的40倍，脑和肝脏等组织中表达量很低，精巢和卵巢中 amhrII的表达量极显著高于其他组织（P<0.01）。对于不同发育时期的个体而言，amhrII在3龄雌雄成鱼中的表达量都极显著高于各时期（23、30、40、60和80日龄）的幼鱼，而且卵巢中的表达量极显著高于精巢（P<0.01）。雌性个体，23、30和40日龄时期amhrII的表达量很低，而60日龄时表达量迅速升高，80日龄时表达量急剧下降，雄性幼鱼各时期 amhrII的表达量都很低。以上数据可以为研究amhrII在红鳍东方鲀精巢分化，性腺发育以及生殖细胞形成过程中起到的作用提供参考。⑶基于RNA-seq技术以3龄红鳍东方鲀成年鱼的精巢和卵巢组织为材料，进行转录组测序分析，通过原始数据筛选过滤在精巢与卵巢分别得到38464975和36092955条比对到红鳍东方鲀基因组数据库上的reads。在精巢和卵巢两个组织中总共有21468个基因得到 KEGG Pathway的注释，共涉及39个代谢途径，这些代谢途径总共分为6大类。每条通路中都含有差异表达基因（DE gene），其中含基因最多的2项为Signal transduction和Infectious diseases。另外，过滤后通过Varscan获取在染色体上所有可能的SNP位点信息，在精巢和卵巢样本中分别发现23879和55675个cSNPs，通过对样品间差异cSNP统计得到在精巢和卵巢中共有的cSNP9553个，而精巢中特有的cSNP14326个，卵巢中特有的cSNP46122个。⑷通过HTSeq统计比对到基因上的数值，然后通过DESeq分析差异表达基因，最后按照表达量倍数差异和表达差异显著性 p-value筛选出差异基因，共鉴定出680个差异表达基因，其中在卵巢中高表达基因有124个，556个基因在精巢中高表达。选取了agrp1、sstr2、foxn4（雄性高表达）和gdf3、gdf15（雌性高表达）5个差异表达基因，以三龄鱼为模板通过qRT-PCR验证转录组测序结果的准确性，qRT-PCR的结果与RNA测序结果基本一致，表明转录组序列的表达分析比较可靠。⑸利用qRT-PCR技术研究各基因在红鳍东方鲀不同发育时期的表达情况发现：在红鳍东方鲀卵巢分化的关键时期（35日龄左右）agrp1在精巢和卵巢中同时高表达，精巢中的表达量大约是卵巢的48倍，可能参与红鳍东方鲀的卵巢分化过程；红鳍东方鲀sstr2基因主要在23日龄、40日龄幼鱼两性性腺中表达，且不同发育时期精巢中的表达量都高于卵巢，40日龄时表达量最高。由此可以推测，sstr2基因在红鳍东方鲀的卵巢分化过程中起重要作用；foxn4基因只在成鱼中表达，而且雄性个体中表达量较高，foxn4基因参与红鳍东方鲀精巢和卵巢的发育过程；对于红鳍东方鲀雌性个体而言，在整个发育时期gdf3持续表达，80日龄以前gdf3的表达量较低，3龄鱼卵巢表达量最高，而雄性个体中只出现在成鱼中。以此可以看出，gdf3参与红鳍东方鲀性腺发育和卵细胞的形成过程，而且在卵巢维持中也可能起到一定作用；gdf15在雌雄红鳍东方鲀的不同发育时期都有表达，40日龄时的表达量最多，大约是雌性的6倍，其他时期的表达量都较少，表明其可能参与卵巢的分化过程。