【摘 要】
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在智能设备已经成为了人类很大部分社会活动信息载体的今天,传统的以PC端为载体的信息系统已逐渐拓展到移动端进行交互。生物样本库对于医学研究如疾病的诊断,预测来说发挥着
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在智能设备已经成为了人类很大部分社会活动信息载体的今天,传统的以PC端为载体的信息系统已逐渐拓展到移动端进行交互。生物样本库对于医学研究如疾病的诊断,预测来说发挥着巨大的作用,它的信息化与可视化则成为样本库建立的重要一环。为了能够让客户远程对生物样本库进行操作,本文设计了基于安卓平台的生物样本库信息管理系统,该系统实现了移动端信息管理系统应有的如用户管理,二维码识别,资源统计,样本出入库等功能,并且根据实际的样本所属疾病分布,建立了相应的病理样本基因表达数据库,利用分类算法对目标样本进行基因层面的表达预测。本文的主要工作和研究内容主要体现在以下几个方面:(1)对信息系统的功能需求进行归纳总结,并设计相应的布局与功能,如用户管理,设备管理,样本查询,样本入库等,选择恰当的布局界面进行业务逻辑和数据展示,并完成了云服务器和网络通信以及数据库的搭建。(2)以生物样本库的样本存储结构为基础,将其抽象为相应的数据结构并完成可视化工作,且信息系统与医院的HIS系统完成了对接,能够提供样本库收录入库的来源为医疗捐献和研究的样本完备的信息,用户可以通过可视化界面查询到样本所属来源个体的医疗信息并且对样本库数据进行远程操作。用户不仅可以看到与服务器实时同步的样本库存储情况和分布,还能根据实际情况对样本库的冰箱设备进行添加和删除。(3)现代生物样本库的建设已经逐渐开始加入对样本的测序信息,对于已经经过二代测序但尚未有医疗检测结果的生物样本,该系统在后台建立的庞大的特征基因数据库以便能够将样本的基因测序信息进行疾病基因预测。本文用GEO基因表达仓库中四种癌症的数十个样本的基因序列经过差异基因分析并去重后作为训练集,采用SVM分类算法分别训练出一系列针对相应癌症基因的分类器。
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