专利制度采取职权分离原则的国家都面临一个共同的问题，即在专利民事侵权诉讼中，当被告主张专利无效抗辩时，需要向另一个专门机关启动专利确权程序，这导致专利民事侵权诉讼审判效率低和当事人诉累。与我国职权分离的模式最接近的日本，通过设立专利权当然无效抗辩来解决此问题。专利权当然无效抗辩是指在专利权民事侵权诉讼中，涉案专利权依照专利权无效宣告程序应当被宣告无效的，原告不能向对方行使其权利。本文尝试研究我国能否仿效日本专利权当然无效抗辩的做法，以提高我国专利侵权诉讼的审判效率和减轻当事人诉累。第一部分阐述专利权无效抗辩的内涵和基本问题；第二部分全面介绍日本专利权当然无效抗辩的含义、由来、立法意义、适用条件及其不足；第三部分阐述我国专利无效抗辩的概况，分析其存在的问题；第四部分通过对我国当前已有的改革思路进行评析、比较，说明我国现阶段引入专利权当然无效抗辩的必要性和可行性；第五部分提出在我国建构专利权当然无效抗辩的方案。本文研究的现实意义在于，从我国现有专利制度之内，探索现阶段我国可行的改革措施，以期有助于解决我国专利制度中职权分离原则的弊端，提高专利民事侵权诉讼的审判效率，促进我国专利制度的有效运行。