小麦赤霉病给生产造成严重产量损失的同时，病原菌在感病籽粒中产生真菌毒素，危害人畜健康。安徽地处南北气候过渡带，耕作制度复杂，是小麦赤霉病的常发区。　　本文以安徽小麦赤霉病菌为研究对象，通过TEF-1α基因数据库FUSARIUM-IDv1.0比对，对不同前茬作物上采集的小麦赤霉病菌的种群类型进行鉴定，研究不同种群赤霉病菌的分布规律以及种群分布的影响因素;另外，利用分子标记技术对安徽采集的六十八个样本菌株进行群体AFLP分析，为探究安徽省小麦赤霉病菌的群体分化和遗传变异规律;以玉米、水稻秸秆为基物，研究光照、土壤含水量对小麦赤霉病菌子囊壳产生的影响;该研究为安徽省小麦赤霉病的科学防治提供理论依据。　　主要研究结果如下:　　1、安徽省小麦赤霉菌群体遗传多样性AFLP分析　　为研究安徽省的小麦赤霉病菌群体分化和遗传变异规律，利用分子标记技术对安徽采集的68个样本菌株进行群体AFLP分析。结果得出，筛选出的八对引物总共扩增出了245个条带，样品菌株之间的遗传距离在0.014～0.021。4个地理类群的遗传距离和它们的地理位置没有显著的相关性。供试的4个群体的基因多样性指数(H)为0.193，香农信息指数(I)是0.321，说明了安徽赤霉病菌的群体有一定的遗传多样性。分子方差分析表明(AMOVA):安徽赤霉病菌群体的变异主要在群体内部，变异系数达到99.80％，群体之间的遗传变异只占0.20％。遗传分化系数Gst为0.049，基因流Nm为9.648，表明安徽赤霉病菌群体之间有频繁的基因交流，比较低的遗传分化。比较来看，安徽南部的群体和安徽北部的群体亲缘关系比较远，安徽北部的群体和安徽中部的群体亲缘关系比较近。　　2、安徽省不同前茬作物区小麦赤霉病菌种群鉴定　　研究自2016年5月中旬，小麦赤霉病发病开始，沿着安徽203和307省道，在凤台县、蒙城县以及涡阳县等地大样本分散采样，总共采集了13个点的不同前茬作物病穗，经过分离纯化，每个点随机提取30个菌株DNA，总共获得390份DNA，通过TEF-1α基因数据库FUSARIUM-ID v1.0比对的方法鉴定菌株类型，明确种群分布。　　试验结果表明:　　2.1小麦赤霉病菌在安徽省不同前茬作物上主要存在两种类型，亚洲镰刀菌与禾谷镰刀菌(Fusarium asiaticum、Fusarium graminearum)。在供试的390个菌株中，F.asiaticum菌株检出252个，检出率达64.61％，F.graminearum菌株检出138个，检出率为35.39％。试验结果证明在安徽北部地区F.asiaticum菌株是优势种群。　　2.2沿307、203省道由北往南，F.graminearum菌株的检出率呈减少趋势。最北的采样点（涡阳马店集镇、西阳镇以及蒙城县岳坊镇）F.graminearum菌株检出率较高，均达到63.33％;凤台县刘集镇前茬作物为水稻的采样点没有检测到F.graminearum菌株。　　2.3同一地点不同前茬作物，前茬为大豆F.graminearum检出率高于玉米前茬，前茬为玉米F.graminearum的检出率高于前茬为水稻，即大豆前茬＞玉米前茬＞水稻前茬。2.4涡阳、蒙城和凤台三地的气候条件相似，2个大豆前茬的采样点中，F.graminearum检出率最大，供试的60个菌株中有43个F.graminearum检出，达到71.67％;7个玉米前茬的采样点中，供试的210个菌株中有87个F.graminearum检出，检出率为41.43％;4个前茬作物为水稻的采样点，F.graminearum菌株检出率最低，供试的120个菌株中只有7个F.graminearum检出，Fgraminearum检出率只占5.83％。　　3、秸秆、光强和土壤含水量对小麦赤霉病菌子囊壳产生的研究　　将玉米、水稻灭菌秸秆接种小麦赤霉病菌，设置6组不同光照强度的处理，比较子囊壳产生的影响。试验结果表明:　　单位面积内，玉米秸秆子囊壳数量的均值为17.19个/cm2，水稻秸秆子囊壳数量均值为6.68个/cm2，玉米秸秆上产生子囊壳的数量明显高于水稻秸秆，随着遮阳强度的增加，同一秸秆上子囊壳的数量呈上升趋势;土壤含水量随着光照强度的降低而增加，子囊壳数量随着土壤含水量的增加而增加。