严重急性呼吸综合症（Severe acute respiratory syndrome, SARS）是由SARS冠状病毒（SARS-CoV）引起的人类新发传染病,S、M、N、E蛋白是SARS-CoV病毒粒子的几种主要结构蛋白。用Lasergene软件系统分析SARS病毒结构蛋白S、M、N蛋白,预测了12个抗原表位,用这些预测表位序列设计组合成四个嵌合基因SSCV-A、SSCV-B、SSCV-C、SSCV-D。人工合成后插入pGEX-6p-1的BamHI和XhoI位点间,构建成融合表达质粒,转化宿主菌BL21经IPTG诱导后嵌合基因表达产物为可溶性蛋白。经免疫印迹试验表明嵌合基因表达产物可被SARS康复患者血清所识别,表明重组融合蛋白具有免疫反应性,提示预测表位中含有SARS-CoV结构蛋白的抗原表位。用纯化的重组融合蛋白GST-SSCV-D和GST-SSCV-A为抗原制备了一系列单克隆抗体。抗SSCV-D的单抗有两株,分别为D3D1和D3C5。将6个S蛋白预测表位分别与GST融合表达。在这6个融合蛋白中,GST-S5可以和单克隆抗体D3C5反应,GST-S2可以和单抗D3D1反应。Western blot分析表明两个单抗所识别的表位均为线性表位。两个表位分别位于SARS-CoV纤突蛋白的第447至458氨基酸残基和789至799氨基酸残基。D3D1表位（447～458）正位于S蛋白与受体结合的结构域中。 2C5是一株SARS-CoV S蛋白特异的有中和活性的单克隆抗体。以2C5为筛选靶分子,筛选噬菌体展示随机7肽库。经三轮淘洗后随机挑选20个噬菌体克隆进行ELISA分析和序列测定。在10个ELISA OD值大于0.2的阳性噬菌体克隆中,有8个噬菌体克隆展示有共同的7肽序列TPEQQFT。展示有该序列的噬菌体克隆能竞争抑制SARS-CoV S蛋白抗原与单抗2C5的结合。与SARS-CoV S蛋白序列比对分析发现该7肽序列散布于S蛋白的第539位到第559位氨基酸上。将S蛋白T₅₃₉PSSKRFQPFQQFGRDVSDFT₅₅₉的21肽与GST进行融合表达,得到了可溶解的融合蛋白。该融合蛋白能不能被单抗2C5识别,但经Western blot分析表明该融合蛋白能被灭活SARS冠状病毒免疫鸡血清识别。表明T₅₃₉PSSKRFQPFQQFGRDVSDFT₅₅₉是S蛋白的一个线性表位,而TPEQQFT为单克隆抗体2C5的模拟表位。 SARS冠状病毒S蛋白在病毒与宿主细胞受体结合、细胞膜融合及入侵、诱导机体产生中和抗体中起重要作用。S蛋白受体结合结构域的核心区域为318～510片段。克隆并融合表达了S蛋白318～510片段,分析表明原核表达的受体结合结构域融合蛋白能被SARS康复患者清和高免动物血清所识别。进一步设计了一套23个覆盖整个该受体结合结构域的长为16氨基酸残基的部分重叠的短肽,并进行了融合表达。用23个融合蛋白对受体结合结构域进行抗原表位作图。结果鉴定出两个抗原表位SRBD3(F₃₃₄PSVYAWERKKISNCV₃₄₉)和表位D3D1(K₄₄₇LRPFERDI₄₅₅)。 SARS冠状病毒S蛋白S1部分在与细胞受体结合以及诱导机体产生保护性中和抗体中发挥重要作用。用PCR扩增S1（12～672）及S1N（12～510）,S1C（318～672）和SRBD（318～510）四个片段。PCR产物分别克隆到表达载体pGEX-6p-1中,经诱导各融合蛋白均以包涵体形式表达。Western