首先,通过对典型单结构域蛋白质尿素变性实验结果的分析,发现在蛋白质变性研究领域中普遍使用的二态模型假说所描述的过程,与真实单结构域蛋白质变性过程并不相符.在分析已有的尿素诱导的蛋白质变性实验结果的基础上,给出了能够反映尿素诱导蛋白质变性过程特征的新表示形式.其次,盐酸胍是常用于使蛋白质变性的另一种重要变性剂,盐酸胍分子与蛋白质分子相互作用的机理和尿素的情形具有相似性.通过对典型的S形变性曲线与二态模型之间的关系所作的详细分析,进一步强调变性过程表现为S型曲线,并非说明单结构域蛋白质的变性过程一定是二态过程.提出了盐酸胍分子与蛋白质分子主链上相邻的二肽形成双氢键的作用机理假设,同样利用吸附反应动力学方法,导出了可描述盐酸胍诱导的单结构域蛋白质变性过程的关系式,并对典型的由盐酸诱导的单结构域蛋白质变性过程进行了分析.第三,从构象渐变的观点对蛋白质热变性现象进行了系统分析.第四,由蛋白质变性的构象渐变模型分析多结构域蛋白质变性过程的特点.最后,在分析血红蛋白分子与氧结合的相互作用特点的基础上,将氧分子与血红蛋白分子结合的过程看作为协同可逆吸附过程.