目的：通过观察六味地黄丸对绝经后骨质疏松症肾阴虚证JAK/STAT信号通路基因的影响,探讨六味地黄丸治疗绝经后骨质疏松症肾阴虚证的分子机制。方法：随机选择绝经后骨质疏松症肾阴虚证组6例,健康绝经后妇女对照组3例。六味地黄丸治疗肾阴虚证组3个月后,用JAK/STAT信号通路芯片检测其基因表达水平,采用△△Ct法判定组间差异是否有统计学意义。结果：1.治疗前肾阴虚证组与正常对照组相比,差异表达基因：PRLR、JUN、JUNB、INSR,表达均下调；2.肾阴虚证组治疗后与治疗前相比,差异表达基因有25条,上调11条,下调14条,其中JUN、JUNB疗后明显上调；3.差异表达基因生物学功能：(1)免疫相关基因：PRL、PRLR、OSM、ISG15、IL4R;(2)细胞生长增殖与细胞周期相关基因：F2、SOCS3;(3)与STAT蛋白相互作用的转录因子和共同活化基因：JUN、JUNB、SMAD3、SMAD5、 SMAD4、SP1、YY1;(4)JAK/STAT信号通路的负反馈调节基因：PIAS1、SOCS4;(5)衔接蛋白基因：SRC、STAM。结论：六味地黄丸治疗绝经后骨质疏松症肾阴虚证的机制可能与其调控JAK/STAT信号通路的相关基因有关,这些基因的功能与免疫调节、细胞生长增殖及成骨生长相关联。