民营企业已成为我国经济的重要组成部分，越来越多的民营企业纷纷上市，成为了上市公司。但是近几年来，民营上市公司的终极控制人侵害上市公司与中小股东利益的案件频繁发生，通过对这些案件进行比较就可以发现，这些民营上市公司往往采用金字塔股权结构的公司治理方式对上市公司与中小股东的利益进行侵害。长此以往，往往打击广大的中小投资者的积极性，不愿意投资于证券市场，造成证券市场一片萧条的局面，所以说保护民营上市公司与中小股东的利益不被侵害是我国证券市场和民营上市公司发展的关键。　　 在金字塔股权结构下，对我国民营上市公司的终极控制人侵害中小股东利益的行为进行了理论分析，并且以A股市场上采取金字塔股权结构的民营企业的2008-2010这三年的数据作为样本，对金字塔股权结构下影响中小股东利益的相关因素进行了实证研究，以此来判断在什么情况下，终极控制人更倾向于对中小股东实施侵害。　　 本文首先从所有权集中与控制性股东、金字塔股权结构定义及其特征、金字塔股权结构下大股东的掏空行为、金字塔股权结构下大股东的支持行为、金字塔股权结构与企业价值这五个方面对国内外学者的研究成果做了简要的回顾。其次本文阐述了金字塔结构的相关概念与理论，并且揭示了我国金字塔类民营上市公司形成的外部条件和内在动因，分析了终极控制人侵占上市公司中小股东利益的可能途径并寻找现实证据，并且对金字塔类民营上市公司终极控制人倾向侵害的原因进行了分析。最后本文根据上述分析提出假设，在我国金字塔股权类的民营上市公司中，对影响中小股东利益的因素进行了实证研究，以此来衡量终极控制人对中小股东的侵害程度。并根据研究结果，提出保护中小股东利益的政策建议。