东亚地区是人类进化和迁徙过程中的一个重要节点，研究东亚人群遗传结构和相互遗传关系，对阐明这一地区的民族渊源乃至现代人类的起源都有重要的意义。云南省是我国民族最多的省份，聚居着26个民族。本研究对傣、佤、拉祜、藏和汉5个群体进行了mtDNA、Y染色体DNA多态性分析，并对3个常染色体STR位点的等位基因频率分布作了初步分析。经过对四个群体的80名个体mtDNA非编码区（D-Loop）高变区Ⅰ 16048～16569及1～41的563bp片段进行序列分析，共发现99个突变位点，这些位点组成61种突变类型。用Kimura的两参数法计算核酸多态度，并用Neighbor-Joining法和UPGMA法分别重建系统进化树，在进化树中，80个mtDNA序列被分成5个群，群Ⅰ中的个体都有其它报道所显示的东亚群体特异的一致特征，即COⅡ／tRAN^Lys基因间序列9bp缺失。4个群体的核酸多态度分别为傣族1.52，佤族1-38，拉祜1.31，藏族1.40，总多态度为1.39。根据核酸多态度计算的净遗传距离重建的进化树显示，傣族和佤族首先聚在一起，距离最近，然后与拉祜族相聚，藏族的距离最远。傣、佤和拉祜族之间较近的遗传距离与他们的地理分布接近是一致的，说明其祖先可能有很近的亲缘关系或历史上发生过基因融合，而藏族则可能起源于其它的古老群体。我们应用3个Y-STR位点和16个Y-SNP位点对这些群体的176份男性标本进行研究。根据Y-STR构成的单倍型构建了一个单倍型网络，网络中的单倍型可被分成两大群，群Ⅰ形成了这几个群体的单倍型主体，群Ⅱ集中了一些较少见的单倍型，这些单倍型可能来自东南亚群体。Y-SNP位点的单倍型为这几个群体的起源提供了