木质素是在微管植物巾仅次于纤维素的主要成分之一，是维持植物体正常结构、运输水分和养料等的主要组成成分，是维管植物能够适应陆地环境的重要特点之一，但是木质素却影响造纸业的造纸工艺和畜牧业生产中的应用。随着多种分析技术和工具的进步提高，在木质索研究领域有了突破性的研究进展。并且利用基因工程技术调控木质素生物合成途径中的关键酶基因的表达可以降低木质素含量或者改变木质素成分，开发新型植物资源，从根本降低成本，减少环境污染。通过基因工程手段可以调控木质素生物合成，降低木质素含量或者改变其组分，来获得适用于工农业生产植物资源，其具有较大的应用价值和环保效益。　　 本文主要在杨树生物芯片的基础上进行研究，取得以下进展:　　 (1)首先对杨树基因芯片数据经GPDNN模型预处理，再经过中位数调平之后，对芯片数据进行聚类分析评价，得到的杨树韧皮部和木质部基因的聚类效果较好，对韧皮部与木质部基因利用R软件做wilcoxo.test相关计算并提取出最终的P-value，挑选p＜0.05时韧皮部与木质部差异显著的基因，经过目的基因功能预测后为生长素响应因子(ARF，Auxinresponse factor)。　　 (2)为了更好的研究我们预测的生长素响应因子基因，从植物转录因子数据库中，挑选杨树ARF家族中37个成员编码区序列，利用MEGA4进行AREs家族进行进化分析可分为3类，同时还得出了基因在不同组织及季节中表达高低不同以及保守域序列高达60％。　　 (3)自定义ARF基因表达量中上调下调基因，并对同一芽、根、木质部及韧皮部中上调基因数目、基因表达信号量以及生长素含量进行相关性分析。首先可以得出在芽、根、木质部及韧皮部中，生长素含量、上调基因数日与基因表达信号量两两之间的相关性在夏秋两季中，相关性均为l或者-1，即高度相关。杨树生长过程中，夏季及秋季生长稳定，从而使得各研究量之间均呈现出稳定性，表现为高度相关。但一旦加入冬季数据后基因表达信号量与生长素含量之间相关性、基因表达信号量与上调基因数目之间相关性降低，但生长素含量与上调基因数日之间相关性影响不是很明显，证明冬季对于上调基因表达的信号量影响较大。